基于RNA-Seq数据筛选的银叶真藓耐干相关基因表达模式研究

• 作者: 张道远 李小双 杨红兰 梁玉青 管开云 高贝
• 来源期刊: 植物生理学报
• 关键词: 银叶真藓 耐干 转录组 RT-qPCR 表达模式
• 年，卷（期）: 2017,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 388-396
• 页数: 9页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13592/j.cnki.ppj.2016.0374

摘要

本文以前期获得的银叶真藓在干旱-复水过程中的转录组数据为基础,选择了9个在干旱-复水条件下基因表达差异明显的相关耐干响应基因,并利用荧光定量PCR技术研究其在干旱-复水、ABA诱导胁迫及盐胁迫下的表达模式.研究结果表明,RT-qPCR实验获得的9个基因在干旱-复水下的表达趋势与RNA-Seq基因表达谱中基因表达规律基本一致,因此较好地验证了RNA-Seq数据的可靠性.在干旱-复水过程中,9个基因均不同程度受到干旱和复水诱导表达,但复水阶段基因诱导表达更为强烈,且大多数基因表达量在复水2 h达到高峰,如ERF、Dehydrin(DHN)和HSF3基因等.在ABA和盐胁迫处理下,9个耐干相关基因中有8个同时受ABA和盐诱导上调表达,其中ERF、DHN和LEA基因受ABA和盐胁迫上调表达最为显著.综上,ERF、DHN和LEA等基因同时受干旱-复水,ABA和高盐强烈诱导表达,可作为将来重点研究的抗逆基因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	管开云	中国科学院新疆理化技术研究所	71	816	18.0	23.0
2	张道远	中国科学院新疆理化技术研究所	44	1021	16.0	31.0
3	杨红兰	中国科学院新疆理化技术研究所	13	63	4.0	7.0
4	李小双	中国科学院新疆理化技术研究所	8	34	2.0	5.0
5	梁玉青	中国科学院新疆理化技术研究所	2	0	0.0	0.0
6	高贝	中国科学院新疆理化技术研究所	6	13	2.0	3.0