大围山微型鸡、云龙矮脚鸡和拉伯高脚鸡mtDNA D-loop遗传多样性分析

• 作者: 孙利民 张永云 欧阳依娜 滕晓红 苗永旺 钱林东 阮谦
• 来源期刊: 云南农业大学学报（自然科学）
• 学科: 农学
• 关键词: 大围山微型鸡 云龙矮脚鸡 拉伯高脚鸡 mtDNA D-loop 遗传多样性 遗传分化
• 年，卷（期）: 2017,（1）
• 所属期刊栏目: 动物科学
• 页码范围: 70-77
• 页数: 8页
• 分类号: S831.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.16211/j.issn.1004-390X(n).2017.01.010

摘要

大围山微型鸡、云龙矮脚鸡和拉伯高脚鸡是近年在云南发现的地方鸡遗传资源,具有优良的种质特性,为了阐明其群体遗传背景,采用mtDNA D-loop区序列为遗传标记,对采自3个地方鸡的共257个样品进行了检测分析.结果表明:大围山微型鸡、云龙矮脚鸡和拉伯高脚鸡的单倍型多样度分别为0.083±0.018、0.851 ±0.029和0.784±0.039;核苷酸多样度分别为0.014 67±0.00045、0.013 42±0.00080、0.011 66 ±0.001 55;群体内遗传距离分别为0.014±0.003、0.014±0.003、0.012 ±0.003.中介网络分析显示:本研究检测的257个样品分布在A、B、C、D、E、F和G等7个世系中,其中大围山微型鸡包含A、B、C、D、E、F和G等7个世系,B、D世系为其主要世系;云龙矮脚鸡包含A、B、C、E、F和G等6个世系,E世系为其主要世系;拉伯高脚鸡包含A、B、E和G等4个世系,G世系为其主要世系.AMOVA分析表明:3个群体间遗传分化指数(Fst)分别为0.120 84、0.239 46、0.26368 (P ＜0.01),群体内遗传变异占80.61％,群体间变异为19.39％ (P＜0.01).本研究结果揭示3个地方鸡群体遗传多样性较丰富,都含有多个母系血统,支持家鸡多个母系起源的观点,但它们之间存在较大的遗传分化.