草地早熟禾干旱胁迫转录组差异性分析

• 作者: 冷暖 刘晓巍 张娜 许立新
• 来源期刊: 草业学报
• 关键词: 草地早熟禾 干旱胁迫 高通量测序 转录组
• 年，卷（期）: 2017,（12）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 128-137
• 页数: 10页
• 字数: 7589字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11686/cyxb2017130

摘要

干旱是影响草地早熟禾生产力的主要因素之一.在没有参考基因组的情况下,为了揭示草地早熟禾在干旱处理下基因表达谱的变化,本文采用了高通量Illumina Hiseq测序平台对草地早熟禾的对照组(CK)与干旱处理组(D)进行转录组测序,并对测序数据进行了分析研究,进一步探究了草地早熟禾干旱应答的分子机制.结果表明,在干旱处理下共检测到24465个差异表达的基因,筛选后获得4143个上调基因和4415个下调基因,共占差异表达基因总数的34.98％.经富集分析后得,与蛋白激酶、蛋白磷酸酶、碳代谢以及ABA等相关的基因可以作为研究草地早熟禾干旱响应机制的主要研究对象.qRT-PCR分析表明,随机选出的8个差异性表达基因的表达趋势与高通量测序结果相一致.此外,还候选了吲哚-3-甘油磷酸合成酶、蛋白磷酸酶、已糖激酶、钙结合蛋白、叶绿素a/b结合蛋白等基因作为与草地早熟禾干旱胁迫相关的应答候选基因,为揭示草地早熟禾耐旱分子机制奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	许立新	北京林业大学草坪研究所	21	100	6.0	9.0
2	张娜	北京林业大学草坪研究所	6	31	3.0	5.0
3	冷暖	北京林业大学草坪研究所	3	18	2.0	3.0
4	刘晓巍		2	14	1.0	2.0