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草地早熟禾干旱胁迫转录组差异性分析
草地早熟禾干旱胁迫转录组差异性分析
作者:
冷暖
刘晓巍
张娜
许立新
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
草地早熟禾
干旱胁迫
高通量测序
转录组
摘要:
干旱是影响草地早熟禾生产力的主要因素之一.在没有参考基因组的情况下,为了揭示草地早熟禾在干旱处理下基因表达谱的变化,本文采用了高通量Illumina Hiseq测序平台对草地早熟禾的对照组(CK)与干旱处理组(D)进行转录组测序,并对测序数据进行了分析研究,进一步探究了草地早熟禾干旱应答的分子机制.结果表明,在干旱处理下共检测到24465个差异表达的基因,筛选后获得4143个上调基因和4415个下调基因,共占差异表达基因总数的34.98%.经富集分析后得,与蛋白激酶、蛋白磷酸酶、碳代谢以及ABA等相关的基因可以作为研究草地早熟禾干旱响应机制的主要研究对象.qRT-PCR分析表明,随机选出的8个差异性表达基因的表达趋势与高通量测序结果相一致.此外,还候选了吲哚-3-甘油磷酸合成酶、蛋白磷酸酶、已糖激酶、钙结合蛋白、叶绿素a/b结合蛋白等基因作为与草地早熟禾干旱胁迫相关的应答候选基因,为揭示草地早熟禾耐旱分子机制奠定了基础.
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草地早熟禾
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草地早熟禾
干旱胁迫
高光强胁迫
越夏性
内容分析
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文献信息
篇名
草地早熟禾干旱胁迫转录组差异性分析
来源期刊
草业学报
学科
关键词
草地早熟禾
干旱胁迫
高通量测序
转录组
年,卷(期)
2017,(12)
所属期刊栏目
研究论文
研究方向
页码范围
128-137
页数
10页
分类号
字数
7589字
语种
中文
DOI
10.11686/cyxb2017130
五维指标
作者信息
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姓名
单位
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1
许立新
北京林业大学草坪研究所
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张娜
北京林业大学草坪研究所
6
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冷暖
北京林业大学草坪研究所
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刘晓巍
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节点文献
草地早熟禾
干旱胁迫
高通量测序
转录组
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
草业学报
主办单位:
中国草原学会
兰州大学草地农业科技学院
出版周期:
月刊
ISSN:
1004-5759
CN:
62-1105/S
开本:
大16开
出版地:
兰州市嘉峪关西路768号(兰州市61号信箱)
邮发代号:
54-84
创刊时间:
1990
语种:
chi
出版文献量(篇)
4091
总下载数(次)
7
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