无蹼壁虎线粒体全基因组及系统发育分析

• 作者: 曾德龙 秦峰 秦新民 高成伟
• 来源期刊: 野生动物学报
• 关键词: 无墣壁虎 线粒体基因组 系统发育
• 年，卷（期）: 2017,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 94-102
• 页数: 9页
• 分类号: Q951+.3|Q78
• 语种: 中文

摘要

经PCR扩增和序列测定,获得了无蹼壁虎(Gekko swinhonis)的线粒体基因组全序列,其总长为16 818 bp,含有13个蛋白质编码基因、2个rRNA基因、22个tRNA基因和1个控制区.各基因的位置、排列顺序及转录方向均和大部分的有鳞目物种一致.无蹼壁虎线粒体基因组的碱基组成分别为:A(31.35％)、T(26.28％)、C(27.71％)、G(14.67％).除Ser(GCU)缺失DHU臂外,其余的21个tRNA都可以形成典型三叶草结构.13个蛋白质编码基因中,除ND2基因以ATA为起始密码子外,其余12个基因均使用ATG为起始密码子.无蹼壁虎5个基因(ND1、ATP8、ATP6、ND4L、ND4)以TAA为终止密码子,ND6和Cytb基因以TAG为终止密码子,CO1以AGA为终止密码,其余5个基因为不完全终止密码TA-或T-(ND2、CO2、ND5和CO3为T-,ND3为TA-).控制区位于tRNAPro和tRNAPhe之间,全长1 456 bp,含有一些终止相关序列和保守序列(TAS,CBS1-3).基于13个蛋白质编码基因氨基酸序列构建的BI系统发育树分析表明,无蹼壁虎与壁虎科的Tarentola mauritanica的亲缘关系最近.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	秦新民	广西师范大学生命科学学院	74	526	13.0	17.0
2	秦峰	广西师范大学生命科学学院	11	37	3.0	5.0
3	高成伟	广西师范大学生命科学学院	14	155	8.0	12.0
4	曾德龙	广西师范大学生命科学学院	6	23	3.0	4.0