铜胁迫下的哈茨木霉Th-33转录组分析

• 作者: Estifanos Tsegaye 丁洁 李昕玥 李梅 王丽荣 蒋细良 陈孝利 马景
• 来源期刊: 中国生物防治学报
• 学科: 农学
• 关键词: 铜胁迫 转录组测序 哈茨木霉 应答
• 年，卷（期）: 2017,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 103-113
• 分类号: S476
• 语种: 中文
• DOI: 10.16409/j.cnki.2095-039x.2017.01.015

摘要

采用Hiseq2500高通量测序平台完成了铜胁迫和对照条件下哈茨木霉Th-33的转录组测序,共检测出差异表达基因891条,其中上调表达基因570条,下调表达基因321条.GO富集分析显示,共有438个差异表达基因参与到673个不同的功能亚类中;KEGG代谢途径分析显示,共有254个差异表达基因归到167个代谢通路中,其中涉及基因最多的是对氨基苯甲酸甲酯降解和氯烷烃、烯烷烃降解通路.通过对差异表达基因和代谢通路分析,推导出菌株Th-33细胞内可能的铜胁迫应答途径.铜胁迫下,Cu2+还原为Cu+、铜转运蛋白(copper transporter,Ctr)的转运途径受到抑制,铜离子可能一部分通过吞饮的作用进入哈茨木霉Th-33细胞,可能通过与谷胱甘肽(GST)结合,或通过P-type ATP酶的外排作用将铜离子向质膜外运输以减少对细胞的毒害作用.