采用基于高分辨率熔解曲线技术的SNP标记定位徐州142无絮的短绒控制基因

• 作者: 于霁雯 吴嫚 吴春珲 张金发 李兴丽 李海晶 王文魁 裴文锋 马启峰
• 来源期刊: 棉花学报
• 学科: 农学
• 关键词: 陆地棉 高分辨率熔解曲线 单核苷酸多态性 简单重复序列 棉纤维 基因定位
• 年，卷（期）: 2017,（1）
• 所属期刊栏目: 研究与进展
• 页码范围: 1-8
• 页数: 8页
• 分类号: S562.03
• 字数: 4869字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11963/issn.1002-7807.201701001

摘要

[目的]定位徐州142无絮(XZ142w)突变体的短绒控制基因n2.[方法]以陆地棉(Gossypium hirsutum L)徐州142(XZ 142)×XZ142w的F2群体为研究对象,利用108个简单重复序列(Simple sequence repeat,SSR)标记对n2进行初步定位,再根据2个亲本材料中有单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphic,SNP)的差异基因设计50对SNP引物,用高分辨率熔解曲线(High resolution melting,HR M)技术从中筛选在亲本间有多态性的SNP引物,并用于后代的基因分型.[结果]利用108个SSR标记将n2初步定位在26号染色体的20.2cM的遗传区间内;用HRM技术筛选到9对亲本间有多态性的SNP引物,成功实现基因分型;并结合以SSR构建的连锁图谱,将n2的遗传区间缩小为19.5 cM,n2与最近的SNP标记Cricaas20158遗传距离为5.5 cM,且遗传图谱上的标记与四倍体陆地棉测序物理图谱基本一致.[结论]HRM技术可用于棉花中的SNP检测和n2基因的定位.