湖北地区克氏原螯虾白斑综合征病毒变异区ORF14/15、ORF23/24基因序列比较分析

• 作者: 刘文枝 周勇 曾令兵 杨星 范玉顶 马杰
• 来源期刊: 淡水渔业
• 学科: 农学
• 关键词: 克氏原螯虾(Procambarus clarkii) 白斑综合征病毒 ORF14/15 ORF23/24 序列分析
• 年，卷（期）: 2017,（5）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 64-71
• 页数: 8页
• 分类号: S945.4
• 字数: 4624字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-6907.2017.05.011

摘要

试验扩增、克隆了在湖北地区采集的19份克氏原螯虾(Procambarus clarkii)白斑综合征病毒(White spot syndrome virus,WSSV)阳性样品的变异区ORF14/15和ORF23/24基因,通过测序比较分析了湖北各WSSV毒株与GenBank公布的标准毒株间在变异区ORF14/15及ORF23/24基因的差异性.结果显示,19份WSSV阳性样品中有部分样品在变异区扩增出ORF14/15、ORF23/24基因片段,变异区基因序列分析发现,与GenBank已公布的标准毒株相比,存在大片段缺失.在变异区ORF14/15,有3个毒株扩增出1 442 bp的片段,4个毒株扩增出630 bp的片段,基于变异区ORF14/15构建的系统进化树显示,这些毒株归属两个不同的分支.在变异区ORF23/24,有2个毒株扩增出大小为2 096 bp的片段,进化分析发现这2个毒株在变异区ORF23/24的遗传距离较近.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	范玉顶	中国水产科学研究院长江水产研究所	30	231	10.0	14.0
2	曾令兵	华中农业大学水产学院	56	582	14.0	22.0
4	周勇	中国水产科学研究院长江水产研究所	36	264	9.0	15.0
5	刘文枝	中国水产科学研究院长江水产研究所	15	35	3.0	5.0
6	马杰	中国水产科学研究院长江水产研究所	11	82	5.0	9.0
9	杨星	华中农业大学水产学院	3	25	2.0	3.0