利用外源RNA作为内参结合qPCR准确检测SF2蛋白RIP富集RNA的效率

• 作者: 周宇荀 李凯 李雨 肖君华 赵磊 陈利
• 来源期刊: 生物技术通报
• 关键词: 甲醛交联免疫共沉淀 内参基因 RNA富集 反转录实时荧光定量PCR
• 年，卷（期）: 2017,（5）
• 所属期刊栏目: 技术与方法
• 页码范围: 78-82
• 页数: 5页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2017.05.011

摘要

利用实时荧光定量PCR技术(Real-time Quantitative polymerase chain reaction,qPCR)检测0.1%甲醛交联RNA免疫共沉淀(RNA Immunoprecipitation,RIP)富集SF2蛋白相互作用的RNA效率,为研究可变剪接因子SF2相互作用RNA的富集效率提供准确的质检方案.采用RIP技术获取HeLa细胞中SF2蛋白相互作用的RNA,等比例加入外源酿酒酵母(BY4741)RNA,并以其 β-actin作为内参基因,利用qPCR检测RIP富集SF2蛋白相互作用RNA的效率.结果显示,0.1%甲醛交联RIP技术特异性捕获得到SF2蛋白-RNA复合物;qPCR技术检测阳性基因PABP、Srsf1在SF2抗体捕获的产物和IgG抗体的产物中相应RNA的浓度差异均在60倍以上.利用qPCR技术,以外源酿酒酵母(BY4741)RNA作为内参,能快速、准确定量检测RNA的富集效率.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	肖君华	东华大学化学化工与生物工程学院	58	137	7.0	9.0
2	李凯	东华大学化学化工与生物工程学院	58	122	6.0	9.0
3	周宇荀	东华大学化学化工与生物工程学院	53	102	6.0	9.0
4	李雨	东华大学化学化工与生物工程学院	3	1	1.0	1.0
5	赵磊	东华大学化学化工与生物工程学院	6	30	4.0	5.0
6	陈利	东华大学化学化工与生物工程学院	3	1	1.0	1.0