牛体外受精胚胎抗氧化相关的长链非编码RNA表达谱

• 作者: 刘岩 孙尉峻 庞云渭 朱化彬 李凤 杜卫华 赵学明 郝海生 郭芹芹
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 谷胱甘肽 长链非编码RNA 转录组测序 共表达分析 靶基因
• 年，卷（期）: 2017,（7）
• 所属期刊栏目: 生物技术与繁殖
• 页码范围: 1229-1240
• 页数: 12页
• 分类号: S823.2
• 字数: 7420字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2017.07.007

摘要

旨在探究培养液中添加3 mmol·L-1谷胱甘肽(Glutathione,GSH)对牛体外受精胚胎中长链非编码RNA(Long non-coding RNA,lncRNA)表达谱的影响.收集8～16-细胞期和桑椹期的胚胎,构建文库后测序,筛选差异lncRNAs,共表达分析后,获得的差异基因进行GO功能注释和KEGG通路分析;同时对lncRNA进行了顺式作用靶基因的预测及其功能分析;通过荧光定量PCR对8个lncRNAs表达水平进行检测,验证测序结果的准确性.测序共得到4 273个lncRNAs,通过对其表达量、长度和外显子个数分析表明,测序数据的可靠性较好.筛选共得到59个差异lncRNAs(其中23个在对照组(不添加GSH)上调,而在处理组(添加3 mmol·L-1GSH)下调;36个在对照组下调,而在处理组上调),在对照组和处理组中,59个lncRNAs分别与754和2 782个蛋白编码基因共表达,这些基因分别参与47和48个功能分类,且主要富集于5和13条信号通路.对23和36个差异lncRNAs临近的145和154个蛋白编码基因进行GO注释,结果表明,这些基因分别参与35和43个功能分类.14个lncRNAs共表达的差异基因参与谷胱甘肽代谢通路.综上表明,在培养液中添加GSH能导致胚胎lncRNA表达谱的变化.