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模拟增温下短花针茅实时荧光定量内参基因的筛选及验证
模拟增温下短花针茅实时荧光定量内参基因的筛选及验证
作者:
曹路
郭慧琴
韩冰
高金玉
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
模拟增温
短花针茅
实时荧光定量PCR
内参基因
摘要:
本研究以荒漠草原植物短花针茅(Stipa breviflora)为材料,在模拟增温处理下,通过qRT-PCR试验分析9个候选内参基因的表达稳定性,运用Delta-CT法,geNorm,normFinder,Bestkeeper软件及RefFinder在线工具进行候选内参基因的稳定性分析.经普通PCR剔除3个内参基因后,6个候选内参基因表达稳定性由高到低排序为:TLF,18s rRNA,APRT,TUBα,EF-1α,Actin2.以TLF作为内参基因,在模拟增温下短花针茅转录组数据库中随机选择5个基因进行验证.qRT-PCR结果表明,5个验证基因在增温与对照之间的相对表达量存在倍率变化,且与转录组测序中的变化趋势一致,从而确定TLF为短花针茅增温处理下的最佳内参基因.
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基因表达的稳定性
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内参基因
桂花组织基因表达中荧光定量PCR内参基因的筛选
植物学
桂花
内参基因
geNorm
NormFinder
BestKeeper
东方泽泻实时荧光定量PCR内参基因的筛选及AoSS基因的组织表达特性分析
东方泽泻
内参基因
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实时荧光定量PCR(qRT-PCR)
表达特性
内容分析
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期刊文献
内容分析
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关键词热度
相关文献总数
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(/年)
文献信息
篇名
模拟增温下短花针茅实时荧光定量内参基因的筛选及验证
来源期刊
草地学报
学科
生物学
关键词
模拟增温
短花针茅
实时荧光定量PCR
内参基因
年,卷(期)
2017,(5)
所属期刊栏目
研究论文
研究方向
页码范围
1020-1028
页数
9页
分类号
Q503
字数
4561字
语种
中文
DOI
10.11733/j.issn.1007-0435.2017.05.016
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
韩冰
内蒙古农业大学生命科学学院
22
192
7.0
13.0
5
郭慧琴
内蒙古农业大学生命科学学院
33
263
10.0
15.0
6
高金玉
内蒙古农业大学生命科学学院
4
12
2.0
3.0
7
曹路
内蒙古农业大学生命科学学院
3
6
1.0
2.0
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被引次数趋势
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二级引证文献(0)
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引证文献(1)
二级引证文献(0)
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节点文献
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短花针茅
实时荧光定量PCR
内参基因
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
草地学报
主办单位:
中国草学会
出版周期:
双月刊
ISSN:
1007-0435
CN:
11-3362/S
开本:
大16开
出版地:
北京海淀圆明园西路2号中国农业大学动科大楼152室
邮发代号:
80-135
创刊时间:
1991
语种:
chi
出版文献量(篇)
3432
总下载数(次)
1
相关基金
内蒙古自然科学基金
英文译名:
Natural Science Foundation of Neimenggu Province
官方网址:
http://www.btsti.com/policy/district/2005-1-27/20051271058235030.htm
项目类型:
辽宁省自然科学基金
学科类型:
期刊文献
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