双孢蘑菇胞外分泌蛋白质组的功能预测及分析

• 作者: 刘旭影 朱丹 李文香 程凡升 阮心眉
• 来源期刊: 食用菌学报
• 关键词: 双孢蘑菇 胞外蛋白 生物信息学 功能注释 酶学分类
• 年，卷（期）: 2017,（3）
• 页码范围: 7-12,封2
• 页数: 7页
• 字数: 4051字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16488/j.cnki.1005-9873.2017.03.002

摘要

以双孢蘑菇(Agaricus bisporus)10448个蛋白为研究对象,综合利用信号肽分析软件SignalP 4.1、跨膜结构预测软件TMHMM v2.0、GPI锚定位点预测软件big-Pi Predictor以及亚细胞蛋白定位软件TargetP1.1等生物信息学软件,筛选双孢蘑菇胞外分泌蛋白质序列,使用分析软件BLAST2GO进行功能注释.筛选得到469个胞外分泌蛋白质序列,统计发现编码这些蛋白质的开放阅读框(open reading frame,ORF)最长为4800 bp,平均为1233 bp.除去假定蛋白质,双孢蘑菇胞外分泌蛋白质的生物代谢途径主要有生物大分子代谢(22.2％)、碳水化合物代谢(17.4％)、脂质代谢(3.2％)、芳香化合物代谢(2.2％)等.同时,共发现133种酶类,其中包括糖苷水解酶(38.5％)、多铜氧化酶(7.4％)、肽酶(7.0％)、果胶裂解酶(4.0％)和羧酸酯酶(2.9％)等.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李文香	青岛农业大学食品科学与工程学院	85	620	13.0	20.0
2	程凡升	青岛农业大学食品科学与工程学院	24	63	5.0	7.0
3	朱丹	青岛农业大学生命科学学院	18	31	4.0	4.0
4	刘旭影	青岛农业大学食品科学与工程学院	1	0	0.0	0.0
8	阮心眉	青岛农业大学食品科学与工程学院	1	0	0.0	0.0