基于物化性质对嗜热蛋白的预测

• 作者: 刀福英 林昊 陈欣欣
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: 嗜热蛋白 热稳定性 伪氨基酸组分 氨基酸物化性质
• 年，卷（期）: 2017,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1-6
• 页数: 6页
• 分类号: Q51
• 字数: 5396字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2017.01.201606001

摘要

嗜热蛋白在高温下能保持稳定性和活性,是研究蛋白质热稳定性的理想模型,开发一个蛋白质热稳定性识别的方法将对蛋白质工程和蛋白质的设计很有帮助.目前的研究中,氨基酸的组成及其物化性质一直被认为和蛋白质的热稳定性相关.本研究筛选出可靠的数据集,包括915个嗜热蛋白和793个非嗜热蛋白.利用蛋白质氨基酸的物化性质和氨基酸的组成表征嗜热蛋白,将二肽氨基酸组成整合到9组氨基酸物化性质中使蛋白序列公式化.支持向量机5折叠交叉验证表明:当gap=0时,290个特征产生的精度最高,为92.74%.因此说明对于分析蛋白质的热稳定性,所建立的预测模型将是一个很有效的工具.