2009-2015年青岛市手足口病病原中柯萨奇病毒A4型VP1区基因特征分析

• 作者: 史晓燕 宫金伶 张凤 柴青 汪照国 苏志磊 赵丹 高汝钦
• 来源期刊: 中国病毒病杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 手足口病 柯萨奇病毒A4型 遗传进化分析
• 年，卷（期）: 2017,（2）
• 所属期刊栏目: 手足口病专题 论著
• 页码范围: 124-128
• 页数: 5页
• 分类号: R373.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.16505/j.2095-0136.2017.02.008

摘要

目的 阐明2009-2015年引起青岛市手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)的病原之一柯萨奇病毒A4型(CV-A4) VP1编码区的基因特征.方法 用荧光RT-PCR法对青岛市2009-2015年HFMD患者的咽拭子标本进行总肠道病毒(EV)、柯萨奇病毒A16 (CV-A16)型和肠道病毒71 (EV-A71)型检测,以半巢式反转录PCR扩增非EV-A71,非CV-A16型肠道病毒VP1区部分基因序列,结合序列分析鉴定CV-A4血清型.对全部CV-A4阳性分离株进行VP1基因全长序列扩增及基因序列测定.用MEGA 5.0软件进行遗传进化及分子特征分析.结果 青岛市2009-2015年7 967份HFMD患者的咽拭子标本中共分离到CV-A4 39株,分别占各年度肠道病毒总构成比的0.18％ (1/541)、0.21％ (2/944)、0.29％ (2/681)、1.37％ (4/292)、2.25％ (12/534)、0.75％ (7/928)和1.86％ (11/591).遗传进化分析显示,94.87％ (37/39)的青岛地区CV-A4分离株位于C2b亚型,5.13％ (2/39)位于C1亚型;青岛C2b亚型病毒株VP1区核苷酸一致性为90.7％～ 100.0％,氨基酸一致性为96.9％～100.0％.结论 CV-A4不是引起HFMD的优势病原,C2b亚型毒株是青岛市CV-A4的优势流行株,同时伴有C1亚型毒株的流行.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	汪照国	青岛市疾病预防控制中心青岛市预防医学研究院	20	89	6.0	8.0
2	赵丹	青岛市疾病预防控制中心青岛市预防医学研究院	6	30	3.0	5.0
3	苏志磊	青岛市疾病预防控制中心青岛市预防医学研究院	5	12	2.0	3.0
4	柴青	青岛市疾病预防控制中心青岛市预防医学研究院	7	40	4.0	6.0
5	宫金伶	青岛市疾病预防控制中心青岛市预防医学研究院	6	40	4.0	6.0
6	史晓燕	青岛市疾病预防控制中心青岛市预防医学研究院	11	46	5.0	6.0
7	张凤	青岛市疾病预防控制中心青岛市预防医学研究院	3	12	2.0	3.0
8	高汝钦	青岛市疾病预防控制中心青岛市预防医学研究院	7	42	4.0	6.0