甘蓝AP2/ERF转录因子的克隆和生物信息学分析

• 作者: 刘寒 王振月 郭慧 金司阳
• 来源期刊: 中国药师
• 学科: 生物学
• 关键词: 电子克隆 甘蓝 AP2/ERF基因 生物信息学
• 年，卷（期）: 2017,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 6-10
• 页数: 5页
• 分类号: Q943.2
• 字数: 3522字
• 语种: 中文

摘要

目的：：运用电子克隆的方法获得甘蓝中AP2/ERF转录因子基因。方法：以拟南芥的AP2/ERF转录因子作为探针，对甘蓝的EST数据库进行搜索，应用相关软件进行序列拼接组装和延长。结果：克隆出甘蓝两个AP2/ERF-B3亚族转录因子BoAP2/ERF1和BoAP2/ERF2。通过生物信息学方法，对两条序列编码蛋白质的氨基酸组成，亲水性/疏水性、理化性质、亚细胞定位、高级结构和空间构型等方面进行了预测和分析。结论： BoAP2/ERF1和BoAP2/ERF2基因由371和352个氨基酸组成、相对分子质量为40.85kDa和39.44kDa的蛋白质，定位于细胞核。序列分析结果显示，该蛋白可能具有信号转导和胁迫响应应答等功能。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王振月		135	789	14.0	19.0
2	郭慧		17	66	5.0	7.0
3	金司阳		5	11	2.0	3.0
4	刘寒		4	11	2.0	3.0