辣椒(Capsicum annuum L.)果实发育及品质相关新microRNA的鉴定与分析

• 作者: CHEN Wenchao DAI Xiongze KANG Linyu LI Xuefeng LIU Yuhua LIU Zhoubin LV Junheng OU Lijun WEI Ge YANG Bozhi YANG Sha ZHANG Yuping ZHANG Zhu ZHOU Shudong
• 来源期刊: 辣椒杂志
• 关键词: 辣椒(CapsicumannuumL.) miRNA 果实发育 果实品质 深度测序
• 年，卷（期）: 2017,（3）
• 所属期刊栏目: 国外瞭望
• 页码范围: 42-50
• 页数: 9页
• 字数: 5037字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-4542.2017.03.011

摘要

MicroRNA(miRNA)是一种非编码的小RNA,在各种生物过程中起着重要的调节作用.前人研究表明,模式植物中miRNA与果实发育相关.然而,人们对辣椒(Capsicum annuum L.)果实品质及发育相关的miRNA了解尚不清楚.本研究利用二代测序技术(Next-generation sequencing technology)比较了不同品种辣椒果实在不同发育时期的小RNA.利用miRDeep2软件从4个样本中共鉴定出了59个已知miRNA和310个新miRNA.预测了新miRNA的靶基因,共656个,并对其中402个靶基因进行了注释.GO分析和KEGG途径表明,某些靶基因与淀粉糖、氨基糖以及核糖代谢相关.qPCR表明一些miRNA的表达模式与其靶向基因相反,该结果为今后研究miRNA调控果实发育和品质形成提供了重要基础.