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摘要:
目的 了解湖北恩施地区和武汉地区手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)病原体肠道病毒71型(EV-A71) VP1的基因特征.方法 收集2010年来自于恩施地区和武汉地区的78例HFMD患儿的咽拭子标本.通过标本接种病毒易感Vero细胞,对产生明显细胞病变效应的阳性标本进行初筛.利用PCR法对初筛阳性标本进行进一步鉴定,对阳性毒株VP1基因序列进行扩增,将其构建到pMD18-T载体上,最后对VP1全长序列进行测序.通过构建系统进化树分析2010年湖北恩施地区和武汉地区EV-A71病毒株的基因型,并分析探讨其与2010年中国大陆其他地区EV-A71病毒株之间的进化关系.结果 从78例手足口病标本中分离得到9株EV-A71,进一步对其VP1序列进行系统进化分析发现所有EV-A71分离株均属于C4亚型.2010年恩施地区和武汉地区EV A71病毒株与2010年中国大陆其他地区EV-A71病毒株在同一进化分支.本研究中分离自伴随震颤患者的EV-A71病毒株(wh64 CHN-10)的VP1-240位点氨基酸残基为丙氨酸,而其余分离自轻症手足口病患者的8株EV-A71病毒株的VP1 240位点为苏氨酸.结论 EV-A71是2010-2011年恩施和武汉地区手足口病的重要病原体之一,属于C4基因型,VP1-240位点的氨基酸可能影响EV-A71的毒力.
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文献信息
篇名 2010年湖北恩施地区和武汉地区肠道病毒71型VP1基因特征分析
来源期刊 中国病毒病杂志 学科 医学
关键词 肠道病毒71型 手足口病 VP1基因 基因型 系统进化分析
年,卷(期) 2017,(2) 所属期刊栏目 手足口病专题 论著
研究方向 页码范围 100-106
页数 7页 分类号 R373.2
字数 语种 中文
DOI 10.16505/j.2095-0136.2017.02.004
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研究主题发展历程
节点文献
肠道病毒71型
手足口病
VP1基因
基因型
系统进化分析
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