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摘要:
目的:评估新鲜冻存组织解冻后RNA降解动力学变化,探讨反复冻融对肝癌组织样本质量的影响.方法:将15例肝癌患者术后组织标本各分11份,其中1份用于组织形态学验证,另外10份于-80℃保存,取4份标本分别在冻融0、1、3、6次后提取RNA,剩余6份标本分别在室温下放置0 min(T0)、5 min(T5)、15min(T15)、30 min (T30)、45 min(T45)及1 h(T60)后进行RNA提取,采用微芯片凝胶电泳技术分析RNA完整性.结果:切片中肿瘤组织面积均超过85%,坏死组织面积均小于15%,符合国际肿瘤基因组联盟制定的标准,且与术后病理学结果符合率达100%.不同冻融次数组织RNA完整性(RNA integrity number,RIN值)比较,差异有统计学意义(P <0.001),而且冻融次数越多,RIN值越低(冻融循环0、1、3、6次后RIN分别为8.27 ±0.42、6.38±0.61、5.08 ±0.61、4.32±0.62).随解冻后RNA提取时间的延长,RNA完整性也不断降低(T0:RIN =8.33±0.52;T5:RIN=7.95±0.48;T15:RIN=7.09±0.40;T30:RIN=5.88±0.39;T45:RIN=5.06 ±0.39;T60:RIN =4.40±0.30),与T0时提取RNA比较,解冻后T30、T45、T60后提取RNA的RIN平均值显著下降,且差异有统计学意义(P<0.001).结论:当研究对RNA质量要求比较高时,肝癌组织解冻不应超过3次,并且在30 min内提取RNA,以保证RNA的完整性.
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文献信息
篇名 冻融循环对肝癌新鲜冻存组织RNA完整性的影响
来源期刊 东南大学学报(医学版) 学科 医学
关键词 冻融 RNA提取时间 RNA完整性
年,卷(期) 2017,(1) 所属期刊栏目 论著
研究方向 页码范围 58-61
页数 4页 分类号 R34
字数 2672字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1671-6264.2017.01.014
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 侯彦深 新疆医科大学附属肿瘤医院麻醉科 10 39 3.0 6.0
2 张园 新疆医科大学附属肿瘤医院肿瘤防治研究所 19 34 3.0 5.0
3 董翔 新疆医科大学附属肿瘤医院肿瘤防治研究所 8 7 2.0 2.0
4 宋佳 新疆医科大学附属肿瘤医院肿瘤防治研究所 5 1 1.0 1.0
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研究主题发展历程
节点文献
冻融
RNA提取时间
RNA完整性
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
东南大学学报(医学版)
双月刊
1671-6264
32-1647/R
大16开
南京市丁家桥87号
28-265
1960
chi
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4012
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