尾分析法在不同规模群体中开展全基因组关联研究

• 作者: 张龙超 武群清 王立贤 黄生强
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 尾分析法 全基因组关联分析 遗传力 选择比例
• 年，卷（期）: 2017,（7）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 1181-1190
• 页数: 10页
• 分类号: S828|S813.1
• 字数: 4519字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2017.07.002

摘要

旨在将尾分析法与全基因组关联分析相结合,初步确定两尾选择的标准.首先,对样本量为2 000、1 500、1 000、500的群体进行全基因组关联分析(GWAS),探索群体规模大小对GWAS结果的影响,然后对各样本量两尾的20％、15％、12％、10％、8％、5％进行GWAS,探索两尾比例的大小对GWAS结果的影响.研究结果表明,检测出的显著关联SNP数目随群体规模及两尾比例的减小而减少.初步确定两尾选择标准为:遗传力为o.38左右的性状,样本量为2 000、1 500、1 000、500,两尾选择比例分别为8％、1o％、10％、20％;遗传力为0.50左右的性状,样本量为2 000、1 500、1 000、500,两尾选择比例分别为5％、5％、10％、15％.以此标准为基础进行GWAS,既能有效检测出最显著SNP位点或区间,又能最大程度地降低研究成本,提高研究效率.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王立贤	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所	90	755	17.0	24.0
2	黄生强	湖南农业大学动物科学技术学院	73	455	12.0	18.0
4	张龙超	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所	28	202	6.0	14.0
5	武群清	湖南农业大学动物科学技术学院	2	2	1.0	1.0