棉花BZR基因家族的全基因组鉴定及表达分析

• 作者: 刘方 周忠丽 王园园 王坤波 王星星 王春英 王玉红 蔡小彦 路普 郭新磊
• 来源期刊: 棉花学报
• 学科: 农学
• 关键词: 棉花 BZR基因 系统发育分析 表达分析
• 年，卷（期）: 2017,（5）
• 所属期刊栏目: 研究与进展
• 页码范围: 415-427
• 页数: 13页
• 分类号: S562.01
• 字数: 6526字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11963/1002-7807.gxllf.20170830

摘要

[目的]油菜素唑抗性因子(Brassinazole resistant transcription factor,BZR)是植物油菜素内酯(Brassinosteroid,BR)信号通路中的l类重要转录因子,通过调控相关基因的表达,参与植物生长发育过程.本研究旨在探索棉花中BZR基因的数量及其功能.[方法]利用生物信息学方法,对雷蒙德氏棉、亚洲棉和陆地棉中的BZR基因进行全基因组鉴定及表达模式分析.[结果]雷蒙德氏棉、亚洲棉和陆地棉中分别有7、7和14个BZR基因;通过序列特征分析和系统发育分析可将棉花BZR基因分为2组(a组和b组).内含子/外显子结构分析发现:大部分BZR基因具有2个外显子,a组成员中均具有较长的内含子序列,b组成员的内含子序列较短,同组BZR成员具有相似的基因结构.基因复制分析表明:片段复制是棉花BZR基因家族扩增的主要方式,棉花BZR基因在进化过程中经历了严格的纯化选择.转录组数据分析表明:14个GhBZR基因在陆地棉的7个组织中特异表达,大多数GhBZR基因在茎、叶、花瓣和雌蕊中高表达;许多GhBZR基因的表达受非生物胁迫诱导.[结论]推测GhBZR基因可能参与棉花抗逆及纤维发育.本研究结果可为棉花BZR基因的生物学功能研究提供信息.