腺病毒7d基因型与7b基因型全基因组比较分析

• 作者: 付扬喜 任洛 倪科 刘恩梅 王莉佳 王鹂鹂 臧娜 谢晓虹 邓昱 郑首燕
• 来源期刊: 病毒学报
• 学科: 医学
• 关键词: 腺病毒 HAdV-7基因型 全基因组 进化树
• 年，卷（期）: 2017,（2）
• 所属期刊栏目: 人类病毒研究论著
• 页码范围: 142-148
• 页数: 7页
• 分类号: R373.9
• 语种: 中文

摘要

为了解重庆地区流行的7型腺病毒(Human adenovirus 7,HAdV-7)基因型型别,从全基因组水平探讨HAdV-7b和HAdV-7d可能的致病性差异,收集儿童急性下呼吸道感染患儿的呼吸道分泌物标本分离培养,提取DNA后进行HAdV-7基因型别鉴定、限制性酶切分析和全基因组测序,再利用MEGA6比较分析.本研究在2009年6月～2013年1月间共收集4334份急性下呼吸道感染患儿的鼻咽抽吸物标本,随机选取2411份进行病毒分离培养,共有164份(164/2411,6.8％)鼻咽抽吸物HAdV阳性,其中HAdV-7 87例.限制性酶切分析显示,随机挑选的3株HAdV-7分离株均为HAdV-7d.CQ1198株行全基因组测序并与其他HAdV-7全基因组构建进化树,结果发现16株中国地区的HAdV-7为HAdV-7d基因型,且上述16株HAdV-7与7d2的同源性为99.9％,与7b的同源性为98.2％.相较于ak40株(HAdV-7b),CQ1198共有49处核苷酸替换,其中20处可导致非同义替换;4处核苷酸插入,其中24 bp和18 bp 2个片段插入分别位于病毒相关RNAⅡ(Virus-associated RNAⅡ,VA RNAⅡ)和L3的pⅥ区域.HAdV-7可有多个基因型致病,且一直处于进化过程中,其主要流行基因型由HAdV-7b变为HAdV-7d.应加强对HAdV分子流行病学监测,明确其进化规律,为HAdV疫苗研发提供分子流行病学依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘恩梅		195	2288	26.0	37.0
2	邓昱		15	135	6.0	11.0
3	王莉佳		121	1299	18.0	30.0
4	付扬喜		2	2	1.0	1.0
5	谢晓虹		19	87	6.0	9.0
6	任洛		9	31	2.0	5.0
7	臧娜		4	13	1.0	3.0
8	王鹂鹂		2	0	0.0	0.0
9	郑首燕		1	0	0.0	0.0
10	倪科		1	0	0.0	0.0