杧果MiCO基因的克隆与表达模式分析

• 作者: 何新华 余海霞 徐趁 方中斌 王博 罗聪 陈锦文
• 来源期刊: 果树学报
• 学科: 农学
• 关键词: 杧果 克隆 CO基因 表达
• 年，卷（期）: 2017,（4）
• 所属期刊栏目: 种质资源·遗传育种·分子生物学
• 页码范围: 418-426
• 页数: 9页
• 分类号: S667.7
• 语种: 中文
• DOI: 10.13925/j.cnki.gsxb.20160263

摘要

[目的]克隆杧果(Mangifera indica L.)MiCO基因并探讨其表达模式,为深入研究该基因的功能奠定基础.[方法]根据从杧果转录组测序数据中获得一个MiCO基因全长序列信息,设计基因全长引物,克隆具有不同开花习性的‘四季杧’和‘紫花杧’2个品种的MiCO基因全长序列,对其序列进行生物信息学分析,并利用荧光定量PCR技术对MiCO基因在杧果不同组织以及年周期的表达情况进行分析.[结果]序列分析显示,2个杧果品种的MiCO基因cDNA全长均为1 150 bp,都包含1个966 bp的开放阅读框,编码322个氨基酸,等电点为5.8,‘四季杧’品种的MiCO蛋白分子质量为35.30 ku,‘紫花杧’品种的MiCO蛋白分子质量为35.22 ku;MiCO基因编码的蛋白具有典型的CO同源蛋白结构,包括B-boxl、B-box2和CCT结构域;系统进化树表明,杧果MiCO蛋白属于第一类CO蛋白,与拟南芥(Arabidopsis thaliana)AtCOL4相似性最高而聚类到一起.基因表达分析表明,MiCO基因在杧果不同组织中均表达,但不同组织的表达水平存在差异.年周期表达分析表明,MiCO基因在杧果成花转变期高度表达,而且在来年的5-6月还存在一个小的表达高峰期,但2个品种不同组织中MiCO基因表达存在差异.[结论]克隆获得杧果MiCO基因全长序列,发现2个具有不同开花习性的杧果品种的MiCO基因核苷酸和氨基酸序列高度同源,只存在少许差异.MiCO基因在杧果成花转变期高度表达,说明MiCO基因与杧果成花关系密切.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	何新华		145	1496	21.0	32.0
2	方中斌		35	165	9.0	11.0
3	罗聪		46	353	9.0	18.0
4	王博		20	52	4.0	6.0
5	余海霞		10	13	1.0	3.0
6	徐趁		6	0	0.0	0.0
7	陈锦文		2	0	0.0	0.0