基于第二代测序技术兰州鲇线粒体基因组全序列测定与分析

• 作者: 吴旭东 张锋 李力 滚双宝 肖伟 连总强
• 来源期刊: 水生生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 兰州鲇 线粒体基因组 结构特征 系统发育
• 年，卷（期）: 2017,（2）
• 页码范围: 334-345
• 页数: 12页
• 分类号: Q173
• 字数: 7482字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7541/2017.41

摘要

研究采用高通量第二代测序技术,构建获得兰州鲇(Silurus lanzhouensis)线粒体基因组全序列,并对全序列特征和结构进行了分析.研究结果表明,兰州鲇线粒体基因组全序列长度为16523 bp,碱基组成具有高A+T低G+C含量的偏向性,具有脊椎动物典型的结构组成.13个PCG基因中存在2种启动子(ATG、GTG)、3种终止子(TAG、TAA和T或TA).除tRNA-Ser(AGN)基因二级结构中DHU臂缺失,其余21个tRNA基因可折叠成典型三叶草结构.12S rRNA二级结构由45个茎环结构组成4个结构域,16S rRNA由54个茎环结构组成6个结构域.含有关键序列标签的控制区(CR)可分为3个不同的结构域:终止序列区(TAS1、TAS2)、中央保守区(CSB-F、CSB-E和CSB-D)和保守序列区(CSB1、CSB2和CSB3).非编码区含有一段保守的控制轻链复制起始的序列区(OL).基于线粒体基因组全序列和通用标签COX1基因标记可区分兰州鲇同其他鲇形目鱼类种质进化关系.