山葡萄种质资源DNA条形码通用序列的筛选

• 作者: 刘海双 宋慧芳 李昌禹 杨义明 艾军 范书田
• 来源期刊: 植物学报
• 关键词: 山葡萄 DNA条形码 鉴定 ITS2 psbA-trnH 序列
• 年，卷（期）: 2017,（6）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 723-732
• 页数: 10页
• 语种: 中文
• DOI: 10.11983/CBB16237

摘要

对山葡萄(Vitis amurensis)种质资源样品的ITS、ITS2、psbA-tmH、rbcL和mat序列进行PCR扩增及测序,优化PCR反应的退火温度,比较各序列的扩增效率、测序成功率、品种间和品种内的差异及barcoding gap图,使用BLAST和NJ树法比较不同序列的鉴定能力,最终从5条DNA片段中筛选出可用于山葡萄种质资源鉴定的DNA条形码通用序列.结果表明,在采集的11份33个山葡萄样品中,psbA-trnH和ITS2序列的扩增与测序成功率较高,其品种间、品种内差异及barcoding gap较ITS、rbcL和matK序列具有明显的优势,且ITS2序列能够鉴别psbA-tmH序列无法鉴别的品种.实验证明,ITS2和psbA-trnH序列是较适合鉴别山葡萄资源的DNA条形码序列组合.DNA条形码弥补了形态学鉴定的不足,可为山葡萄种质资源的准确鉴定提供科学依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李昌禹	中国农业科学院特产研究所	48	470	12.0	20.0
2	艾军	中国农业科学院特产研究所	100	513	12.0	19.0
3	范书田	中国农业科学院特产研究所	70	360	10.0	17.0
4	杨义明	中国农业科学院特产研究所	61	339	11.0	17.0
5	宋慧芳	中国农业科学院特产研究所	5	15	3.0	3.0
6	刘海双	中国农业科学院特产研究所	8	23	3.0	4.0