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云南省输入性及本地感染间日疟原虫裂殖子表面蛋白1基因5区序列的多态性分析
云南省输入性及本地感染间日疟原虫裂殖子表面蛋白1基因5区序列的多态性分析
作者:
孙艾明
徐艳春
毛祥华
董莹
邓艳
陈梦妮
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
间日疟原虫
裂殖子表面蛋白1
多态性
摘要:
目的 分析云南省输入性及本地感染间日疟病例的疟原虫裂殖子表面蛋白1(Plasmodium vivax merozoite surface protein-1,PvMSP-1)基因5区序列及其等位基因的多态性. 方法 2012年8月-2015年9月,收集云南省输入性及本地感染间日疟病例的滤纸血样和流行病学史等相关信息.提取疟原虫DNA,PCR扩增PvMSP-1基因5区并测序,与M75674、AAN86237、M60807、ABJ53045、AAN86238、BAA18977等参比序列进行比对,用Mega 5.04、Arlequin3.5.1软件分析PvMSP-1基因5区的序列多态性,计算序列间保守位点、遗传距离和多样性指数,并根据氨基酸序列间的遗传距离绘制聚类树状图. 结果 2012年8月-2015年9月,共收集间日疟病例血样847份.其中,云南省本地感染61份,非洲、缅甸感染的分别为66和720份.847份血样中278份扩增出Pv MSP-1基因5区片段,206份测序成功.PvMSP-1基因5区片段编码氨基酸长193~222 aa.氨基酸序列比对分析显示,Sal-1、Belem和Recombine基因型分别占59.2%(122/206)、23.3% (48/206)和17.5%(36/206),缅甸、非洲感染和云南本地感染血样中Sal-1基因型分别占58.8% (104/177)、11/15和7/14.Sal-1、Belem、Recombine基因型分别有51、9和6个亚型.这66个亚型的Shannon-wiener指数(H')和期望杂合度(He)分别为0.955和0.567.206条DNA序列的同源位点为665 bp、保守位点为11.3% (75/665)、变异位点为88.7% (590/665),不同感染来源地的分离株与不同的氨基酸参比序列的遗传距离均小于0.4.聚类分析显示,206条PvMSP-1基因5区氨基酸序列按基因型聚类成2个大类,有3个次级分支,其中,Recombine与Belem基因型的相似度为91%~92%,高于与Sal-1基因型的82%~83%. 结论 云南省输入性及本地感染的间日疟原虫分离株PvMSP-1基因5区存在多种亚型,在Sal-1、Belem、Recombine等3种基因型中,Sal-1型占优势.
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基因
多态性
我国不同疟区间日疟原虫裂殖子表面蛋白1(PvMSP-1)基因多态性研究
间日疟原虫
裂殖子表面蛋白1
多态性
序列分析
云南省恶性疟原虫多药抗性基因Asn86Tyr多态性调查
恶性疟原虫
氯喹抗性
等位基因特异PCR
Pfmdr1多态性
海南省消除疟疾后期间日疟原虫裂殖子表面蛋白1基因(MSP-1)多态性检测
间日疟
裂殖子表面蛋白
多态性
消除疟疾
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文献信息
篇名
云南省输入性及本地感染间日疟原虫裂殖子表面蛋白1基因5区序列的多态性分析
来源期刊
中国寄生虫学与寄生虫病杂志
学科
医学
关键词
间日疟原虫
裂殖子表面蛋白1
多态性
年,卷(期)
2017,(1)
所属期刊栏目
论著
研究方向
页码范围
1-7
页数
7页
分类号
R382.311
字数
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中国寄生虫学与寄生虫病杂志
主办单位:
中华预防医学会
中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所
出版周期:
双月刊
ISSN:
1000-7423
CN:
31-1248/R
开本:
大16开
出版地:
上海市瑞金二路207号
邮发代号:
4-362
创刊时间:
1983
语种:
chi
出版文献量(篇)
3255
总下载数(次)
2
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英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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