基于高通量测序患炭疽病草莓根际与健康草莓根际细菌群落的比较研究

• 作者: 孙海峰 张春芬 曹秋芬 李倩 聂园军 肖蓉 邓舒
• 来源期刊: 中国农学通报
• 学科: 农学
• 关键词: 草莓炭疽病 高通量测序 细菌多样性 群落结构
• 年，卷（期）: 2017,（11）
• 所属期刊栏目: 生物科学
• 页码范围: 14-20
• 页数: 7页
• 分类号: S154|S668.4
• 语种: 中文

摘要

研究旨在比较患炭疽病草莓与健康草莓根际土壤细菌群落多样性,了解其细菌群落生态特征,为找到有效的生防菌奠定基础.本研究基于土壤细菌16S rDNA V3-V4区基因多样性,利用IlluminaMiseq高通量测序技术进行比较研究.研究得出:与健康对照相比,患病土壤细菌的OTUs数目及多样性指数均较低;在门水平上,变形菌门、拟杆菌门、浮霉菌门等是2种生境共有的优势类群;在属水平上,2种生境的优势菌丰度有差异,患病土壤的假单胞菌属丰度显著降低,气单胞菌属丰度显著升高;而且,健康土壤的解毒类菌、固氮菌、光合菌和硝化菌丰度均高于患病土壤.健康草莓根际土壤细菌丰富度及多样性均高于患病草莓,2种生境细菌菌群结构有差异,且健康土壤中对植物有益的功能微生物群体含量高于患病土壤.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	曹秋芬	山西省农业科学院生物技术研究中心	92	817	16.0	22.0
2	孙海峰	山西大学化学化工学院	36	509	12.0	21.0
3	聂园军	山西省农业科学院农业资源与经济研究所	34	84	5.0	7.0
4	张春芬	山西省农业科学院果树研究所	11	65	5.0	8.0
5	邓舒	山西省农业科学院果树研究所	8	30	3.0	5.0
6	肖蓉	山西省农业科学院果树研究所	10	35	4.0	5.0
7	李倩	山西省农业科学院小麦研究所	10	45	5.0	6.0