Ydj1p锌指结构突变体对底物结合影响的分子动力学模拟分析

• 作者: 刘冠宏 孙玉娜 宋有涛 张桥石 薛友林
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: Ydj1p 锌指结构 突变体 底物结合 分子动力学模拟
• 年，卷（期）: 2017,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 90-96
• 页数: 7页
• 分类号: Q523
• 字数: 4243字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.20160715001

摘要

Ydj1p是酵母细胞质中一种主要的Ⅰ型Hsp40分子伴侣,Ydj1p锌指结构在传递底物给Hsp70时发挥重要的作用,锌指结构域的两个锌离子结合位点区域(ZBD Ⅰ和ZBDⅡ)与半胱氨酸形成配位键对底物传递中维持结构稳定非常重要.本研究通过分子动力学手段对Ydj1p与各锌指结构突变体进行了模拟,分析ZBD Ⅰ突变体关键残基C143S、C201S,ZBDⅡ突变体关键残基C162S、C185S的突变影响Hsp40与Hsp70的底物传递.分析结果表明,当锌指部位的氨基酸发生突变,不仅能影响Ydj1p的结构稳定性,也能影响底物的传递,并且锌指结构Ⅰ突变体和锌指结构Ⅱ突变体之间也具有明显差异.通过结合能量的分析以及构象变化比对,揭示了Ydj1p以及各锌指结构突变体底物结合能力的强弱,这与生化实验研究了Ydj1p锌指结构与Hsp70合作,帮助多肽传递的功能是至关重要的结果较为相近.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	宋有涛	辽宁大学环境学院	62	181	7.0	10.0
5	薛友林	辽宁大学轻型产业学院	53	88	5.0	6.0
6	孙玉娜	辽宁大学生命学院	5	5	2.0	2.0
7	刘冠宏	辽宁大学环境学院	1	0	0.0	0.0
8	张桥石	辽宁大学生命学院	3	2	1.0	1.0