原文服务方: 西北林学院学报       
摘要:
为了更好地了解云南松基因组特征,分析了云南松基因组中微卫星序列的分布特征,采用FLAF-seq测序技术,共获得1 970条微卫星重复序列,利用MISA通过对Unigene序列的分析,鉴定出7种类型的SSR.7种微卫星序列中主要以单碱基重复类型为主,共1 104个,约占重复序列总数的56.04%,其次是双碱基和三碱基重复类型,分别占总数的27.66%和11.68%,四碱基重复类型数量30个,占重复序列总数的1.52%,五碱基、六碱基重复类型在总重复序列中占比最少,均为0.2%,混合微卫星占2.7%.在单碱基重复类型中占优势的重复单元是A/T碱基,双碱基重复类型中占优势的重复单元是(AT)n/(TA)n碱基,三、四、五碱基重复类型中,占优势的重复单元不明显,但几种碱基重复类型中,都包含着丰富的A和T.所得到的微卫星重复序列中以长度<20bp序列的微卫星数量最多,微卫星长度≥20 bp的只占总数的10.81%.可为后续云南松遗传多样性的研究及SSR引物筛选等提供一定的理论依据.
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文献信息
篇名 云南松基因组微卫星序列特征分析
来源期刊 西北林学院学报 学科
关键词 云南松 基因组 微卫星 重复类型
年,卷(期) 2017,(3) 所属期刊栏目 林木遗传育种与培育
研究方向 页码范围 104-107
页数 4页 分类号 S791.257
字数 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1001-7461.2017.03.19
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 王兵益 中国林业科学研究院资源昆虫研究所 26 110 6.0 8.0
2 廖声熙 中国林业科学研究院资源昆虫研究所 55 522 13.0 20.0
3 崔凯 中国林业科学研究院资源昆虫研究所 32 151 6.0 10.0
4 贺圆 5 7 2.0 2.0
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基因组
微卫星
重复类型
研究起点
研究来源
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研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
西北林学院学报
双月刊
1001-7461
61-1202/S
大16开
1984-01-01
chi
出版文献量(篇)
5683
总下载数(次)
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