分子伴侣HdeA与底物蛋白SurA作用机制的模拟研究

• 作者: 乔建军 于延庆 吴昊 周丹丹 李艳妮
• 来源期刊: 生物化学与生物物理进展
• 关键词: HdeA 分子伴侣 SurA 分子对接 分子动力学
• 年，卷（期）: 2017,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 242-252
• 页数: 11页
• 语种: 中文
• DOI: 10.16476/j.pibb.2016.0347

摘要

分子伴侣HdeA与底物蛋白间的相互作用可帮助底物蛋白复性,这是肠道致病菌得以在酸性环境中幸存的重要原因之一.为探究HdeA发挥伴侣活性的作用机制,本研究采用分子对接和分子动力学的方法,模拟了HdeA与底物蛋白SurA间的相互作用,计算了二者的结合自由能.通过分析HdeA-SurA复合物体系的作用模式、氢键作用以及能量分解的结果,确定了HdeA与底物蛋白SurA结合时发挥重要作用的关键氨基酸残基.该研究结果为以后采用实验手段探究HdeA与底物蛋白之间的作用提供了重要的理论参考,同时为今后设计与开发HdeA的抑制剂提供了理论指导依据.