游离二氧化硅所致肺成纤维细胞转分化过程中 DNA 甲基化差异基因的 MeDIP-seq检测

• 作者: 侯建永 姚武 郝长付
• 来源期刊: 郑州大学学报（医学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 矽肺 DNA甲基化 甲基化DNA免疫共沉淀测序
• 年，卷（期）: 2017,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 5-8
• 页数: 4页
• 分类号: R135.2
• 字数: 3433字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13705/j.issn.1671-6825.2017.01.002

摘要

目的：检测游离二氧化硅所致肺成纤维细胞转分化过程中可能存在的DNA甲基化差异基因并探讨其可能作用机制。方法：原代培养肺成纤维细胞和肺泡巨噬细胞，建立共培养的矽肺体外模型，采用甲基化DNA免疫共沉淀测序技术检测分析不同染毒时间（0、24、48 h）的肺成纤维细胞之间的DNA甲基化差异基因，并采用DA-VID工具对检测到的甲基化差异基因进行KEGG的通路富集分析。结果：共发现8791个基因的DNA甲基化程度在3个染毒时间组中均存在差异，DAVID工具分析发现这些差异主要集中在代谢、环境信息过程、细胞过程、生物体系统、人类疾病相关通路等通路中。结论：矽肺形成过程中存在大量DNA甲基化程度发生改变的基因，且这些基因涉及多个通路。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	姚武	郑州大学公共卫生学院劳动卫生学教研室	105	506	12.0	17.0
2	郝长付	郑州大学公共卫生学院劳动卫生学教研室	44	159	7.0	10.0
3	侯建永	郑州大学公共卫生学院劳动卫生学教研室	5	10	2.0	2.0