盐生海藻杜氏盐藻的转录组测序以及注释

• 来源期刊: 浙江大学学报（英文版）（B辑：生物医学和生物技术）
• 学科: 生物学
• 关键词: 杜氏盐藻 转录谱 代谢过程与调控 调节机制 盐胁迫
• 年，卷（期）: 2017,（10）
• 页码范围: 833-844
• 页数: 12页
• 分类号: Q36
• 语种: 英文

摘要

目的:解析杜氏盐藻代谢过程,主要关注盐胁迫下累积的代谢物(渗透平衡产物、多胺和类胡萝卜素)的代谢.创新点:本研究通过高通量测序产生了大量来自杜氏盐藻整个生长周期的转录组数据,描述了杜氏盐藻在盐胁迫下累积的渗透平衡产物、多胺和类胡萝卜素的代谢过程.另外通过该手段也进一步分析了盐胁迫处理下,抑制精胺合成底物的供应可能会缓解盐藻增殖对胡萝卜素含量的影响.方法:以来自3个不同生长时期的杜氏盐藻为材料,进行大规模转录组测序.在转录组功能注释的基础上,预测了杜氏盐藻盐胁迫下累积的渗透平衡产物(图3)、多胺(图4)和类胡萝卜素(图5)的代谢路径.利用相对定量聚合酶链反应(qPCR)技术构建了相关代谢路径中关键基因的表达谱(图6).结论:通过杜氏盐藻转录组测序共获取了39820条单一序列.在功能注释和聚类分析的基础上预测了杜氏盐藻盐胁迫下累积的渗透平衡产物(甘油和脯氨酸)、多胺以及类胡萝卜素的代谢路径.相关代谢途径的关键酶的表达谱分析,说明盐能够调节甘油、脯氨酸以及多胺的代谢过程.抑制精胺合成底物的供应可能会缓解盐藻增殖对胡萝卜素含量的影响.