肺癌中Hsa-miR-98靶基因生物信息学分析

• 作者: 杨毅 牛瑞芳 王兆松
• 来源期刊: 生物技术
• 学科: 生物学
• 关键词: 肺鳞癌 Hsa-miR-98 生物信息学 基因本体论 信号通路富集
• 年，卷（期）: 2017,（4）
• 所属期刊栏目: 技术与方法
• 页码范围: 355-363
• 页数: 9页
• 分类号: Q811.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.16519/j.cnki.1004-311x.2017.04.0058

摘要

[目的]分析肺鳞癌中Hsa-miR-98的靶基因及参与的生物学过程和信号通路.[方法]分析TCGA中收录的肺鳞癌患者的Hsa-miR-98及生存数据,通过4个靶基因数据库和表达数据分析Hsa-miR-98靶基因,利用BiNGO富集分析靶基因功能,通过DAVID数据库富集分析靶基因信号通路.[结果]高表达Hsa-miR-98延长肺鳞癌患者总生存率和无复发生存率.综合4个数据库分析结果,得到Hsa-miR-98的113个靶基因,其中82个在肺鳞癌患者癌与癌旁差异表达.GO分析表明4个基因参与细胞胶原的组成,59个基因参与细胞的生命活动,KEGG通路富集到7条通路,包括肿瘤发生发展、阿米巴运动、胞外基质的形成等.[结论]82个Hsa-miR-98靶基因通过7条信号通路,影响细胞生命活动,进而调控肿瘤发生发展,使高表达Hsa-miR-98患者生存期延长.