DMU、GBS和Herdsman3个软件育种值估计的比较

• 作者: 丁向东 唐韶青 张越 张金鑫 张锁宇 杨宇泽 邱小田
• 来源期刊: 中国畜牧杂志
• 学科: 农学
• 关键词: 猪 育种软件 育种值 相关性
• 年，卷（期）: 2017,（7）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 29-35
• 页数: 7页
• 分类号: S828.2
• 字数: 4967字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19556/j.0258-7033.2017-07-029

摘要

猪育种管理软件为猪育种工作和养猪场的管理提供了便利,育种值估计是育种管理系统的核心.但在实际应用中,不同软件育种值估计不一致给一线育种工作者带来了困扰.本研究选取国内广泛使用的GBS、Herdsman育种管理软件和科学研究中常用的DMU程序,以大白猪、长白猪和杜洛克猪的育种数据和模拟数据为材料,研究3款软件估计育种值之间的差异.结果表明:在数据和遗传评估模型及初始参数一致的情况下,DMU4和GBS由于采取相同的算法,估计育种值一致性高达0.99以上,DMU5育种值估计与DMU4高度一致;DMUAI基于约束极大似然方法,在相同条件下育种值估计准确性略高于DMU4和GBS;由于模型和初始参数未知,本研究Herdsman育种值估计与GBS和DMU一致性偏低.但鉴于Herdsman算法与DMU4和GBS一致,可以预测在相同模型下,GBS、Herdsman与DMU育种值估计应无差异.研究同时表明,软件对遗传评估评估结果影响不大,主要是具体遗传评估模型的配置.