黑线仓鼠OPN5的部分克隆及生物信息学分析

• 作者: 吴明 徐来祥 徐金会 薛慧良 邓文翠
• 来源期刊: 曲阜师范大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 黑线仓鼠 OPN5 克隆 生物信息学 光感受器
• 年，卷（期）: 2017,（4）
• 所属期刊栏目: 生物科学
• 页码范围: 95-101
• 页数: 7页
• 分类号: Q74
• 字数: 4643字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-5337.2017.4.095

摘要

神经视蛋白(Neuropsin,OPN5)是非视觉成像蛋白的重要成员之一,主要分布于动物的眼睛、脊髓、大脑和睾丸中,是动物感光物质的重要组成成分.文章以黑线仓鼠(Cricetulus barabensis)为动物材料,利用RT-PCR技术克隆得到黑线仓鼠OPN5基因的cDNA序列1340 bp(KY949483).生物信息学分析表明,该序列包括一个完整的开放阅读框架1134 bp,部分5'端非翻译区和部分3'端非翻译区;序列G+C含量远高于A+T含量,提示其Tm值较高,热稳定性强;编码377个氨基酸;蛋白质序列组成、跨膜区和疏水性分析、信号肽分析等均表明,OPN 5序列包含N端胞外区、跨膜域和C端胞内域,整体疏水性较强,没有信号肽,不属于分泌蛋白,这些特征均与OPN 5膜蛋白的属性相符;OPN 5包括7个跨膜拓扑结构、一个G蛋白偶联受体家族和一个视黄醛结合位点,第7个跨膜结构的赖氨酸残基与OPN 5对紫外光的敏感性有关;同源性对比显示,黑线仓鼠与中国仓鼠(Cricetulus griseus)、金仓鼠(Mesocricetusauratus)、小鼠(Mus musculus)亲缘关系较近,而与灵长类、偶蹄类的物种亲缘关系均较远,这与传统的物种分类相一致,证实所克隆到的序列正确,同时提示OPN 5进化的保守性.本研究为探究OPN 5视蛋白在动物繁殖调控中的作用奠定了基础,具有重要理论的意义.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	徐来祥	曲阜师范大学生命科学学院	95	654	12.0	22.0
2	薛慧良	曲阜师范大学生命科学学院	51	182	8.0	11.0
3	徐金会	曲阜师范大学生命科学学院	40	116	7.0	9.0
4	吴明	曲阜师范大学生命科学学院	8	0	0.0	0.0
5	邓文翠	曲阜师范大学生命科学学院	2	0	0.0	0.0