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基于iTRAQ技术的不同耐旱性甘薯苗期根系差异蛋白分析
基于iTRAQ技术的不同耐旱性甘薯苗期根系差异蛋白分析
作者:
张海燕
张立明
段文学
汪宝卿
王庆美
董顺旭
解备涛
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
甘薯
干旱
苗期
根系
iTRAQ
摘要:
为从蛋白水平揭示不同甘薯品种的苗期耐旱性差异,明确甘薯耐旱性生理机制,以耐旱性强的济薯21 (JS)和耐旱性弱的济紫薯1(JH)为材料,采用PEG-6000模拟田间梯度干旱胁迫过程,采用iTRAQ技术开展甘薯苗期根系全蛋白组差异蛋白分析.结果表明,在4个比较组中,共筛选到567个差异表达蛋白,其中上调表达蛋白302个,覆盖率达20%以上的蛋白占鉴定总蛋白数的58.6%.GO分析发现,JS苗期根系差异蛋白主要集中在胁迫响应、非生物刺激响应等生物过程,而JH苗期根系差异蛋白主要集中在糖基复合物代谢和辅酶代谢等生物过程,干旱均主要影响2个品种的细胞质、细胞溶质等细胞组分,2个品种的差异蛋白分子功能均涉及催化活性、氧化还原酶活性等方面.KEGG分析发现,正常条件下,耐旱性强的较耐旱性弱的甘薯品种苗期根系中的过氧化物酶(POD)和肉桂醇脱氢酶(CAD)表达上调;在干旱条件下,次生代谢合成过程中的苯丙烷合成通路中上调表达的差异蛋白最多,耐旱性强的JS苗期根系中主要是胁迫响应相关蛋白,而耐旱性弱的JH苗期根系中主要是能量代谢相关蛋白.总之,干旱对甘薯苗期根系细胞质中次生物质合成和能量代谢影响较大,耐旱性强的甘薯苗期根系氧化还原酶类蛋白表达上调,不同耐旱性甘薯苗期根系在蛋白组学水平上响应干旱的生理调控途径存在明显差异.本研究为甘薯耐旱性品种生理鉴定和耐旱基因发掘提供了线索.
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文献信息
篇名
基于iTRAQ技术的不同耐旱性甘薯苗期根系差异蛋白分析
来源期刊
核农学报
学科
关键词
甘薯
干旱
苗期
根系
iTRAQ
年,卷(期)
2017,(10)
所属期刊栏目
植物诱变育种·农业生物技术
研究方向
页码范围
1904-1912
页数
9页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.11869/j.issn.100-8551.2017.10.1904
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
汪宝卿
山东省农业科学院作物研究所
50
490
13.0
19.0
2
张立明
100
1245
19.0
31.0
3
王庆美
山东省农业科学院作物研究所
77
875
15.0
27.0
4
解备涛
山东省农业科学院作物研究所
45
417
13.0
18.0
5
张海燕
山东省农业科学院作物研究所
62
496
12.0
18.0
6
董顺旭
山东省农业科学院作物研究所
37
280
10.0
14.0
7
段文学
山东省农业科学院作物研究所
18
93
6.0
8.0
传播情况
被引次数趋势
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(/年)
引文网络
引文网络
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参考文献
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引证文献(2)
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iTRAQ
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研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
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核农学报
主办单位:
中国原子能农学会
中国农业科学院农产品加工研究所(前中国农业科学院原子能利用研究所)
出版周期:
月刊
ISSN:
1000-8551
CN:
11-2265/S
开本:
16开
出版地:
北京市海淀区圆明园西路2号农产品加工研究所
邮发代号:
创刊时间:
1987
语种:
chi
出版文献量(篇)
4988
总下载数(次)
6
总被引数(次)
55367
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