草鱼GH基因3'部分序列多态性与生长性状及肌肉成分的相关性分析

• 作者: 张猛 李家乐 沈玉帮 王沈同
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 草鱼 GH基因 多态性 生长性状 肌肉成分
• 年，卷（期）: 2017,（9）
• 页码范围: 1329-1337
• 页数: 9页
• 分类号: Q785|S965
• 字数: 6585字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11964/jfc.20160910546

摘要

为了解草鱼GH基因多态性与早期生长性状及肌肉成分的相关性,实验利用直接测序法从156尾草鱼GH基因的3'部分序列中共筛选到9个变异位点(分别命名为SNP 1～SNP9:G2825A、G2914T、T2966G、A3002T、T3022C、A3301G、C3463T、C3547T、C3620T).卡方检验结果显示,9个位点均未显著偏离Hardy-Weinberg平衡,且均表现为中等多态性(0.25＜PIC＜0.5);经连锁不平衡分析发现,SNP3、SNP4和SNP5位点为一组完美连锁不平衡,SNP2、SNP7、SNP9位点为一组完美连锁不平衡;GH基因3'部分序列5个位点单倍型分析共发现6种单倍型,其中Hap1 (30.4％)所占的比例最高,Hap6(4.8％)所占比例最低.利用GLM及多重比较对草鱼GH基因中9个SNPs多态性与早期生长性状和肌肉成分进行相关性分析,发现SNP2和SNP3位点的纯合突变型在体质量、体长和粗脂肪性状上均显著高于野生型和杂合突变型;在双倍型分析时得出了相似的结果,同时含有SNP2和SNP3位点纯合突变的双倍型组合在生长和粗脂肪性状上均显著性高于其他组合.研究表明,草鱼GH基因中SNP2和SNP3位点与早期生长性状及肌肉成分存在显著性相关,可作为草鱼生长及肉质改良的候选辅助分子标记,并且为进一步对相关变异位点的功能验证奠定研究基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李家乐	上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	91	1011	19.0	27.0
2	沈玉帮	上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	11	110	5.0	10.0
3	王沈同	上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	2	6	1.0	2.0
4	张猛	上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	3	16	2.0	3.0