杨树MYB转录因子家族基因应答盐胁迫表达特性分析

• 作者: 周博如 张雪梅 李晰妍 赵凯
• 来源期刊: 植物研究
• 学科: 农学
• 关键词: 杨树 MYB转录因子 生物信息学 RT-qPCR
• 年，卷（期）: 2017,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 424-431
• 页数: 8页
• 分类号: S792.11
• 字数: 4157字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7525/j.issn.1673-5102.2017.03.013

摘要

MYB转录因子家族是植物中数量最多的转录因子家族之一,在植物次生代谢调节、信号转导和抗逆等生物过程起重要作用.根据MYB转录因子结构域组成差异可分4个亚家族:即1R-MYB (MYB-relaed)、R2R3-MYB、3R-MYB和4R-MYB.其中,R2R3-MYB亚家族数量最多,可进一步分为22个亚组;利用生物信息学分析杨树MYB转录因子蛋白序列的保守结构域、系统发生、基因组定位、氨基酸组成和理化性质等;参照拟南芥MYB转录因子功能,预测杨树MYB转录因子功能;基于84K杨转录组测序和RT-qPCR分析,从301个杨树MYB转录因子基因中筛选出69个应答盐胁迫基因(P≤0.05).其中,上调表达基因32个,下调表达基因37个.该研究可为进一步研究杨树MYB家族基因功能提供参考依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周博如	东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室	14	78	5.0	8.0
2	赵凯	东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室	7	53	3.0	7.0
3	李晰妍	东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室	1	1	1.0	1.0
4	张雪梅	东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室	5	12	2.0	3.0