魁蚶(Scapharca broughtonii)不同地理群体的遗传多样性及种群结构

• 作者: 刘寒苗 刘志鸿 吴彪 周丽青 孙秀俊 杨爱国
• 来源期刊: 渔业科学进展
• 学科: 生物学
• 关键词: 魁蚶 COⅠ基因 12SrRNA基因 18SrRNA基因 28SrRNA基因 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2017,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 92-99
• 页数: 8页
• 分类号: Q953.1
• 字数: 6199字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11758/yykxjz.20160906001

摘要

采用 PCR 技术扩增了中国山东胶南、长岛、蓬莱、荣成和韩国统营5个地理群体魁蚶(Scapharca broughtonii)样本的COⅠ、12S rRNA、18S rRNA和28S rRNA基因部分序列,分析了魁蚶5个地理群体的遗传多样性和系统进化关系.经测序拼接、剪接后,分别获得67条776 bp 的COⅠ序列、72条443 bp的12S rRNA序列、75条909 bp的18S rRNA序列和75条894 bp的28S rRNA序列.序列分析结果显示,5个群体75个个体的COⅠ序列中共检测到466个多态位点,32种单倍型,单倍型多样性指数为0.925,核苷酸多样性指数为0.086;12S rRNA序列中共检测到292个多态位点,43种单倍型,单倍型多样性指数是0.928,而核苷酸多样性为0.0856;在18S rRNA序列中,5个群体都表现出丰富的遗传多样性,共有74种单倍型,909个多态位点,单倍型多样性指数为1.0,核苷酸多样性指数为0.717,其中胶南群体变异位点最多、多样性最丰富;通过对28S rRNA部分序列的分析发现,75个个体共检测到27个多态位点,18种单倍型,单倍型多样性指数为0.778,核苷酸多样性指数为0.289,蓬莱群体多样性最丰富.遗传距离分析结果表明,韩国群体与其他4个群体的遗传距离较大;基于COⅠ序列的系统进化树显示有多个聚群.