苹果LysM类受体激酶基因家族鉴定与表达分析

• 作者: 姜雪峰 左存武 张卫娜 毛娟 苏静 陈佰鸿 马宗桓
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 苹果 LysM-类受体激酶 生物信息学分析 表达
• 年，卷（期）: 2017,（4）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 733-742
• 页数: 10页
• 分类号: S661.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.16420/j.issn.0513-353x.2016-0695

摘要

以LysM (PF01476)和Pkinase (PF00069)保守域全蛋白序列为种子序列,在全基因组范围比对分析了苹果(Malus×domestica Borkh.)LysM-RLK家族的成员,对其家族成员的理化性质、进化关系、染色体分布、基因结构等进行了分析;基于已公布的转录组学数据,分析了LysM-RLK基因在苹果组织、发育过程和生物胁迫中的表达情况.通过分析,共获得12个苹果LysM-RLK基因,其氨基酸序列大小介于553 ～1 053,分子量介于62.65 ～ 119.04 kD,等电点介于5.11 ～ 7.45,主要位于质膜;根据进化分析将其分为3个亚组,亚组内各成员的外显子—内含子结构呈现较为相似的特征.基因表达数据显示,苹果的4个LysM-RLK基因表达存在较大的组织特异性,7个基因在苹果腐烂病和再植病发病过程中为差异表达.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈佰鸿	甘肃农业大学园艺学院	128	886	13.0	25.0
2	毛娟	甘肃农业大学园艺学院	91	429	10.0	18.0
3	马宗桓	甘肃农业大学园艺学院	28	47	4.0	5.0
4	左存武	甘肃农业大学园艺学院	19	31	3.0	5.0
5	苏静	甘肃农业大学园艺学院	4	14	2.0	3.0
6	姜雪峰	甘肃农业大学园艺学院	5	4	2.0	2.0
7	张卫娜	甘肃农业大学园艺学院	5	5	2.0	2.0