陆地棉MIKCC基因家族的全基因组分析

• 作者: 周娜 张天真 汪露瑶 胡艳
• 来源期刊: 棉花学报
• 学科: 农学
• 关键词: 陆地棉 MIKCC基因 功能分化 miRNA
• 年，卷（期）: 2017,（6）
• 所属期刊栏目: 研究与进展
• 页码范围: 495-503
• 页数: 9页
• 分类号: S562.03
• 字数: 4782字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11963/1002-7807.znhy.20170913

摘要

[目的]MIKCC是1类保守的转录因子家族,参与调控植物的开花时间和花器官发育.通过对MIKCC家族进行全基因组学分析,为深入研究MIKCC在棉花开花及花器官发育的分子调控机理提供基础.[方法]利用HMMER 3.0及pfam种子文件鉴定棉花全基因组MIKCC基因,结合其表达量进行偏向表达及聚类分析.[结果]在陆地棉基因组中共鉴定发现100个MIKCC基因,分为11个亚类.表达聚类分析显示,棉花MIKCC基因的表达模式大致可分为4个不同的类群,说明这类基因在棉花进化中出现了功能分化.100个MIKCC基因中,有12个基因具有miRNA靶位点.[结论]研究结果显示MIKCC家族基因在棉花纤维中存在功能分化,而且可能受到miRNA的调控,这为进一步研究该家族基因的功能提供信息参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张天真	南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室	119	3890	35.0	58.0
2	周娜	南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室	2	5	2.0	2.0
3	汪露瑶	南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室	2	2	1.0	1.0
4	胡艳	南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室	4	2	1.0	1.0