日本血吸虫成虫的非编码RNA高通量测序分析

• 作者: 喻祎哲 曾凡胜 杨杰 王红梅 秦志强
• 来源期刊: 热带病与寄生虫学
• 关键词: 非编码核糖核酸 miRNA 高通量测序 日本血吸虫病 成虫
• 年，卷（期）: 2017,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 31-35
• 页数: 5页
• 字数: 2376字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-2302.2017.01.009

摘要

目的 通过对日本血吸虫成虫做高通量测序分析,鉴定已知miRNA的表达水平,预测新miRNA的序列结构及生物学功能.方法 首先提取日本血吸虫成虫miRNA进行深度测序,其次对miRNA做数据分析、统计长度分布与比对注释,鉴定已知miRNA表达水平,最后对发现的新miRNA序列进行结构和功能的预测.结果 将构建文库中日本血吸虫表达的miRNA与最新Sanger miRBase数据库中的miRNA比对.结果显示,在鉴定的miRNA中,sja-mir-125b是表达量最高的miRNA,另外sja-bantam,sja-mir-10,sja-mir-71a,sja-mir-36,sja-mir-61的表达量也较高,上述六种miRNA表达量占到已知miRNA表达量的94.6%.本研究发现了十种在日本血吸虫表达量最高的新miRNA,并对新miRNA进行序列及结构的预测.结论 日本血吸虫成虫新miRNAs例如sja-mir-125b的发现将为深入研究其在血吸虫发育与致病的生物学功能打下基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王红梅		3	14	2.0	3.0
2	曾凡胜		2	9	2.0	2.0
3	秦志强	中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所	8	26	3.0	5.0
4	喻祎哲		1	4	1.0	1.0
5	杨杰		1	4	1.0	1.0