全基因组序列的系统发育与重组分析鉴定我国马铃薯Y病毒株系

• 作者: 杨宏凯 沈建国 蔡伟 邹文超 高芳銮
• 来源期刊: 激光生物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 马铃薯Y病毒 系统发育分析 重组分析 株系鉴定
• 年，卷（期）: 2017,（4）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 350-359
• 页数: 10页
• 分类号: S435.32
• 字数: 4638字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1007-7146.2017.04.011

摘要

为明确我国马铃薯 Y 病毒(Potato virus Y,PVY)株系组成及其在不同寄主上的分布特征,文章对31条PVY中国分离物的基因组编码区进行了系统发育及重组分析.系统发育分析结果显示,最大似然法(maximum likelihood, ML)和邻接法(neighbor-joining,NJ)重建的系统发育拓扑结构基本一致,GF_YL20、FZ10、DF、SD1、1116和9703-3等6个分离物均未与已知株系相聚,其他株系来源相同的分离物以较高的自展值相聚成簇,显示出较强的株系特异性.重组分析显示, 31个PVY分离物中,共有28个PVY分离物均检测到具有显著的重组信号,这些分离物主要包括PVYN-Wi、PVYNTN和PVYNTN-NW三种株系.进一步分析显示,分离物1104、DF、SD1、1116和9703-3为未报道过的PVY新重组分离物.株系统计结果显示PVY重组株系已上升为优势株系,生产上需要密切注意这些株系,尤其新重组分离物的发展动态.以上结果表明,综合应用PVY全基因组序列的系统发育和重组分析,可以实现PVY株系的准确鉴定.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	沈建国	福建出入境检验检疫局检验检疫技术中心	45	201	8.0	12.0
2	高芳銮	福建农林大学植物保护学院	13	92	5.0	9.0
3	杨宏凯	福建农林大学植物保护学院	7	7	1.0	2.0
7	邹文超	福建农林大学植物保护学院	3	7	1.0	2.0