苯对C3H/He小鼠骨髓细胞转录组表达的影响:基于转录组测序技术

• 作者: 孙凤梅 尹立红 张娟 曹萌 浦跃朴
• 来源期刊: 环境与职业医学
• 学科: 医学
• 关键词: 苯 RNA-seq 骨髓细胞 差异表达 信号通路
• 年，卷（期）: 2017,（7）
• 所属期刊栏目: 论著丨原创精选
• 页码范围: 577-585
• 页数: 9页
• 分类号: R114
• 语种: 中文
• DOI: 10.13213/j.cnki.jeom.2017.17281

摘要

[目的]应用转录组测序(RNA sequencing,RNA-seq)技术,研究苯对小鼠骨髓细胞转录组表达和信号通路的影响,为苯对小鼠骨髓细胞毒性的可能作用机制提供科学线索.[方法]将C3H/He小鼠随机分为苯暴露组[160mg/(kg·d)]与对照组[0mg/(kg·d)],每组10只,以皮下注射的方式染毒,每周5次,连续4周.分离小鼠的骨髓细胞,应用RNA-seq技术对苯暴露和对照组小鼠的骨髓细胞进行转录组测序,并对测序结果进行基因差异表达、基因功能与信号通路富集以及基因共表达分析.[结果] RNA-seq结果显示,苯染毒后共有227个基因的表达发生明显变化,其中122个基因下调,105个基因上调.基因功能与信号通路富集分析结果显示,这些差异基因主要富集在免疫、凋亡、代谢、氧化应激、造血谱系等功能和通路上.差异基因共表达分析显示,调控度大于10的基因有14个,其中Ccr9、Xafl、Flt3、Cd72分别是细胞免疫、细胞凋亡、造血细胞谱系、造血细胞分化等通路上的重要基因.[结论]苯暴露可导致小鼠骨髓细胞基因表达谱发生变化,可引起小鼠骨髓细胞免疫、凋亡、代谢、氧化应激、造血谱系等功能与通路发生变化,其中Ccr9、Xaf1、Flt3、Cd72可能起关键性调控作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	浦跃朴	东南大学公共卫生学院环境医学工程教育部重点实验室	176	2029	25.0	35.0
2	尹立红	东南大学公共卫生学院环境医学工程教育部重点实验室	139	1526	20.0	32.0
3	孙凤梅	东南大学公共卫生学院环境医学工程教育部重点实验室	3	14	2.0	3.0
4	张娟	东南大学公共卫生学院环境医学工程教育部重点实验室	77	187	7.0	11.0
5	曹萌	东南大学公共卫生学院环境医学工程教育部重点实验室	12	41	4.0	6.0