汉中黑稻花青素合成酶基因克隆及生物信息学分析

• 作者: 尹亚军 张涛 杜伟立 王令 路宏朝
• 来源期刊: 福建农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 汉中黑稻 花青素合成酶 基因克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2017,（2）
• 所属期刊栏目: 作物科学
• 页码范围: 124-129
• 页数: 6页
• 分类号: S511
• 字数: 5109字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19303/j.issn.1008-0384.2017.02.004

摘要

花青素合成酶(Anthocyanidin Synthase, ANS)是植物花青苷生物合成途径末端的关键酶,催化无色花色素到有色花色素的转变.为研究汉中黑稻的ANS多样性及起源,采用克隆测序的方法对汉中7种品种黑稻的ANS基因序列进行分析.采用生物信息学方法,对该基因序列进行对比,并构建系统进化树和同源树,对其编码蛋白从基本理化性质、亚细胞定位、跨膜结构域、信号肽、导肽、二级结构和三级结构等方面进行预测和分析.结果表明7种汉中黑稻存在黑稻1、黑稻2两种基因序列,开放阅读框均为1 128 bp,编码375个氨基酸.进化树表明黑稻1和黑稻2与籼稻、粳稻、浦竹仔、小麦等禾本科植物较近的亲缘关系,同源性分析表明黑稻1和黑稻2与籼稻等植物的ANS具有高度的同源性.氨基酸序列比对发现黑稻1和黑稻2仅有326位氨基酸不同.黑稻1的ANS蛋白含有2OG-FeⅡ_Oxy加氧酶的保守结构域.ANS蛋白三级结构预测,发现黑稻1和籼稻存在差异,推测ANS可能是花青苷合成中起重要作用的关键酶.这些结果表明ANS基因是一个古老的基因,可以作为种属鉴定的参考基因,可能是影响黑稻花青苷生物合成的主要基因之一.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	路宏朝	陕西理工大学生物科学与工程学院	53	201	8.0	12.0
2	张涛	陕西理工大学生物科学与工程学院	91	350	9.0	13.0
3	王令	陕西理工大学生物科学与工程学院	24	31	4.0	4.0
4	尹亚军	陕西理工大学生物科学与工程学院	6	9	2.0	3.0
5	杜伟立	陕西理工大学生物科学与工程学院	10	11	2.0	2.0