基因芯片筛选肌浸润性膀胱癌分子标志物

• 作者: 成松桃 王行环 陈亮
• 来源期刊: 现代泌尿外科杂志
• 关键词: 基因芯片 膀胱癌 生物标记 差异表达基因 生物信息学
• 年，卷（期）: 2017,（12）
• 所属期刊栏目: 临床研究
• 页码范围: 915-920
• 页数: 6页
• 分类号: R73
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-8291.2017.12.007

摘要

目的 通过基因芯片技术及生物信息学方法筛选潜在的膀胱癌生物标记物.方法 收集3对肌浸润性膀胱癌组织和正常膀胱上皮组织提取总RNA并行基因芯片杂交检测,获得差异表达基因进行相关生物信息学分析及验证.结果 按设定的标准,共获得下调基因516个,上调基因32个;基因本体(GO)功能富集显示差异基因主要参与细胞生长与维持、细胞通讯、信号传导等;京都基因与基因组百科全书通路(KEGG pathway)富集发现这些基因涉及的通路与上皮间质转化、磷脂通路等相关;通过蛋白互作网络进一步筛选出11个核心基因,TCGA肿瘤数据库验证11个核心基因在膀胱癌表达均降低.结论 本研究筛选出11个可能作为膀胱癌潜在生物标记的候选基因,为后续膀胱癌研究提供有价值的线索.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王行环	武汉大学中南医院泌尿外科	103	444	12.0	15.0
2	陈亮	武汉大学中南医院泌尿外科	66	592	13.0	22.0
3	成松桃	武汉大学中南医院泌尿外科	2	3	1.0	1.0