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注意力缺陷多动障碍和低出生体重共有的生物学通路研究
注意力缺陷多动障碍和低出生体重共有的生物学通路研究
作者:
刘可智
向波
喻明兰
张涛
李涛
梁雪梅
贺文英
陈晶
雷威
黄朝华
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
注意力缺陷多动障碍
低出生体重
全基因组关联分析
网络分析
摘要:
目的 探讨注意力缺陷多动障碍(attention deficit hyperactivity disorder,ADHD)与低出生体重(birth weight,BW)共有的生物学通路.方法 基于i-Gsea4GwasV2软件对BW的全基因组关联分析(genome-wide association analysis,GWAS)的结果 进行后续分析(生物通路数据来源于Reactome),选出P<0.05,false discovery rate(FDR)<0.25的生物通路,并在ADHD的GWAS结果中重复,选出P<0.05,FDR<0.25的生物通路纳入后续网络分析.应用DAPPLE和Reatome FI软件对生物通路中的基因进行网络分析,并对每个Cluster中的基因进行GO(gene ontology)富集.采用Centiscape 2.0软件计算基因网络的degree和betweenness值来探究核心节点(基因).用加权基因共表达网络分析(weighed gene co-expression network analysis,WGCNA)探究生物通路中基因间的共表达.脑基因表达数据来源于BrainSpan,并对每个基因模块进行GO富集.结果 在BW的基因集分析中发现了11个生物通路,其中2个通路(硒氨酸代谢和糖代谢相关疾病)在后续的ADHD分析中重复.对2个通路中的130个基因进行网络分析,发现了一些亚网络基因模块与小脑形态、海马发育以及突触结构的可塑性调控等有关.共表达网络分析发现120个基因通过质量控制并共表达在3个基因模块中,这些模块主要与突触组织调控、突触结构和活性调节等有关.结论 AD HD和低BW有着相同的生物调节过程,而这些过程的异常可能是导致注意力缺陷多动障碍的原因.
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篇名
注意力缺陷多动障碍和低出生体重共有的生物学通路研究
来源期刊
中华医学遗传学杂志
学科
关键词
注意力缺陷多动障碍
低出生体重
全基因组关联分析
网络分析
年,卷(期)
2017,(6)
所属期刊栏目
论著
研究方向
页码范围
844-848
页数
5页
分类号
字数
3264字
语种
中文
DOI
10.3760/cma.j.issn.1003-9406.2017.06.013
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研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
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期刊影响力
中华医学遗传学杂志
主办单位:
中华医学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1003-9406
CN:
51-1374/R
开本:
大16开
出版地:
成都市人民南路3段17号
邮发代号:
62-163
创刊时间:
1984
语种:
chi
出版文献量(篇)
6832
总下载数(次)
17
总被引数(次)
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