水牛泌乳期与非泌乳期乳腺组织miRNAs表达谱鉴定及差异表达分析

• 作者: 任艳萍 刘庆友 古景开 张晓溪 沈朋雷 石德顺 蔡小艳 邓凯 鲍正攀
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 水牛 泌乳期和非泌乳期 乳腺组织 miRNA表达谱 信号通路
• 年，卷（期）: 2017,（9）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 1635-1647
• 页数: 13页
• 分类号: S823.83
• 字数: 7343字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2017.09.008

摘要

旨在鉴定分析水牛乳腺泌乳期和非泌乳期miRNA的表达谱和差异作用机制.采集水牛泌乳期和非泌乳期乳腺组织,利用Solexa测序技术构建2个时期miRNAs表达谱,鉴定前体miRNAs、成熟miRNAs和新miRNAs,分析miRNAs的第一偏好性核苷酸和染色体分布,发掘水牛泌乳期和非泌乳期高表达及差异表达miRNAs.结果显示,本研究构建了水牛泌乳期和非泌乳期乳腺组织2个miRNA表达谱,分别获得12 768 110和12 569 467条18～31 nt的高质量序列.测序确认了归属259个miRNAs家族的359个成熟miRNAs和363个pre-miRNAs及5个水牛特有的miRNAs.U是19和25 nt miRNAs的5'端最普遍的核苷酸.bbu-let-7b、bbu-let-7a、miR-26a和miR-21等miRNAs在2个时期均呈现高表达;bbu-miR-148a、143、200c、200a和bbu-let-7f等miRNAs在非泌乳期特异性高表达.bbu-miR-125b、29a和bbu-let-7c等miRNAs在泌乳期特异性高表达.bbu-miR-148a、143、200a、141和30a-5p等miRNAs在泌乳期的表达量下降为非泌乳期的1/2以下.而bbu-miR-26a、29a、125b、99a和bbu-let-7c等miRNAs在泌乳期表达量大于或等于2倍非泌乳期丰度.本研究构建了水牛泌乳期以及非泌乳期乳腺组织2个miRNAs表达谱,测序确认了259个水牛miRNAs家族的359个成熟miRNAs和363个前体miRNAs,5个水牛特有miRNAs和10个高差异表达miRNAs,为进一步阐明奶水牛泌乳关键miRNAs作用机制奠定了基础.