肺囊康定产生菌Glarea lozoyensis线粒体基因组序列的再分析

• 作者: 刘杏忠 张姝 张永杰 赵宇翔 陈里
• 来源期刊: 微生物学报
• 关键词: 基因转移 Glarea lozoyensis 内含子tRNA 线粒体基因组 诱变剂
• 年，卷（期）: 2017,（5）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 724-736
• 页数: 13页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13343/j.cnki.wsxb.20160416

摘要

[目的]Glarea lozoyensis是抗真菌药物卡泊芬净的产生菌,其突变菌株ATCC 74030的线粒体基因组已被报道.我们此前的研究发现诱变剂能引起该菌某些细胞核基因的突变,但诱变剂是否也能引起线粒体DNA序列的改变并不清楚.[方法]组装野生型菌株ATCC 20868的线粒体基因组,并与发表的突变型菌株ATCC 74030的线粒体基因组进行比较.通过PCR验证野生和突变菌株线粒体基因组间表现差异之处,并利用正确的线粒体基因组序列进行新的分析.[结果]我们成功组装出野生型菌株ATCC20868的线粒体基因组,通过比较其与发表的ATCC 74030的线粒体基因组序列,发现存在6处单核苷酸变异位点和2处具有长度差异的区域.然而,随后的PCR验证和序列比较并没有发现2个菌株间存在这些差异.最初观察到的碱基差异是因为发表的ATCC 74030线粒体基因组存在序列错误.有趣的是,在Glarea lozoyensis的线粒体基因组中,我们发现存在3个具有内含子的tRNA基因和1个rnpB基因.同时,该菌线粒体基因组中存在多种重复序列,在其线粒体和细胞核基因组间也存在明显的DNA片段重复事件.[结论]诱变剂没有引起G.lozoyensis线粒体DNA的任何改变;发表的ATCC 74030的线粒体基因组存在序列错误.我们报道G.lozoyensis正确的线粒体基因组序列,并且发现该菌线粒体和细胞核基因组间频繁的基因交流.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张姝	山西大学生命科学学院	14	289	7.0	14.0
2	刘杏忠	中国科学院微生物研究所真菌学国家重点实验室	55	895	15.0	28.0
3	张永杰	山西大学生命科学学院	18	227	6.0	15.0
4	赵宇翔	山西大学生命科学学院	3	4	1.0	2.0