河北3个日本沼虾野生群体线粒体DNA D-Loop基因序列变异及种群遗传结构分析

• 作者: 万海付 康现江 武小斌 穆淑梅 肖国华 董新培 薛建民
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 日本沼虾 D-Loop基因 遗传多样性 遗传分化
• 年，卷（期）: 2017,（2）
• 页码范围: 182-188
• 页数: 7页
• 分类号: Q347|S931
• 字数: 4196字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11964/jfc.20160610437

摘要

为进一步了解白洋淀与衡水湖日本沼虾种质资源现状,实验通过对白洋淀南淀(SB)、白洋淀北淀(NB)、衡水湖(HS)日本沼虾群体线粒体DNA D-Loop基因片段进行扩增和测定,得到935 bp的序列用于进一步的分析,其中变异位点80个,占分析位点的8.56％,含有77个简约信息位点,平均转颠换比值(Ts/Tv)为7.28,4种碱基在所得序列中平均含量为A(42.65％)、G(9.08％)、T(36.98％)、C(11.29％),其中A+T含量为79.63％,明显高于C+G含量.AMOVA分析结果显示,群体间的遗传分化系数FST=0.2336,群体间遗传变异占23.36％,群体内遗传变异占76.64％,群体间具有较高程度的遗传分化.运用K-2-P模型构建了3群体的23个单倍型的NJ系统发育树,单倍型之间并没有按照单倍型所属群体的分类聚簇,表现为不同群体个体相互交错形成复杂的簇群.群体中性检验、错配分析表明,日本沼虾近期未曾经历过种群扩张.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	康现江	河北大学生命科学学院	133	1116	18.0	24.0
2	穆淑梅	河北大学生命科学学院	75	598	13.0	20.0
3	武小斌	河北大学生命科学学院	2	9	2.0	2.0
4	薛建民		20	10	1.0	2.0
5	肖国华		27	45	4.0	5.0
6	董新培	河北大学生命科学学院	3	25	3.0	3.0
7	万海付	河北大学生命科学学院	1	4	1.0	1.0