猪ADAM10基因编码区及其剪接体克隆、序列分析与组织表达研究

• 作者: 周晓龙 杨松柏 裴悦 赵阿勇 陈闻达
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 猪 ADAM10基因 克隆 剪接体 组织表达
• 年，卷（期）: 2017,（9）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 1579-1590
• 页数: 12页
• 分类号: S828.2
• 字数: 6682字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2017.09.003

摘要

旨在克隆猪ADAM10基因及其剪接体的编码区(Coding sequence,CDS),利用生物信息学方法分析其序列结构和生物学功能,并揭示ADAM10基因及其剪接体mRNA在猪组织中的表达特征.根据GenBank中公布的猪ADAM10基因的序列信息,设计特异性引物,运用反转录PCR(Reverse transcription-PCR,RT-PCR)方法结合T/A克隆技术进行ADAM10基因及其剪接体编码区的克隆,利用生物信息学方法分析ADAM10及其剪接体蛋白的结构,同时用半定量PCR(Semi-quantitative PCR)分析猪ADAM10基因完整型及其剪接体mRNA在猪不同组织中的表达谱.结果显示,克隆和测序获得两种ADAM10 CDS序列,其中完整型CDS长2 247 bp,编码748个氨基酸;剪接型CDS缺失外显子2～7和部分外显子8,其长度为1 344 bp,编码447个氨基酸.和完整型蛋白相比,猪ADAM10剪接体编码的蛋白不存在前引导序列,但存在完整的信号肽序列和跨膜结构域,并含有金属蛋白酶域和解聚素结构域,其三级结构也和完整型一致.序列比对和进化树分析表明,猪ADAM10完整型蛋白在物种间具有较高的保守性.半定量PCR分析表明,ADAM10基因完整型mRNA在脾中表达量较高,在肾、乳腺、腿肌、输卵管、卵巢、子宫、小肠等组织中低水平表达;ADAM10基因剪接体mRNA在肺中表达量较高,在脾和胃中也有低水平表达.本研究为进一步探究猪A DAM10基因的结构和生物学功能提供了基础资料.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵阿勇	浙江农林大学动物科技学院	20	44	4.0	6.0
2	裴悦	浙江农林大学动物科技学院	2	0	0.0	0.0
3	周晓龙	浙江农林大学动物科技学院	5	5	2.0	2.0
4	杨松柏	浙江农林大学动物科技学院	6	4	1.0	2.0
5	陈闻达	浙江农林大学动物科技学院	1	0	0.0	0.0