东北林蛙PDK1基因的克隆及生物信息学分析

• 作者: 巩珊珊 张晶钰 曲俐俐 柴龙会 肖向红 邵婕
• 来源期刊: 野生动物学报
• 关键词: 东北林蛙 PDK1基因 基因克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2017,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 641-647
• 页数: 7页
• 分类号: Q959.5
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-0127.2017.04.020

摘要

PDK1是PI3K/Akt信号通路中的一个重要的激酶.在哺乳动物中,P13 K/Akt信号通路是一条保守的通路,通过激活下游的因子对糖代谢、脂肪代谢以及蛋白质代谢,细胞的增殖、分化、凋亡等起调节控制作用.本研究基于东北林蛙转录组数据,从中鉴定出PDK1基因3条Unigene序列,并通过RACE法克隆了PDK1基因的全长cDNA,命名为rdPDK1,其全长为1 990 bp,开放阅读框长1 674 bp,编码557个氨基酸.进行生物信息学分析,推测该基因编码的蛋白质相对分子质量63.7 kD,等电点为7.21.该蛋白第82 ～ 344个和443 ～ 549个氨基酸是2段保守结构域STKc激酶域和PH调节结构域.同源性分析表明rdPDK1蛋白与HsPDK1蛋白氨基酸序列一致率为79％,相似率为100％;与MmPDK1蛋白氨基酸序列一致率为80％,相似率为100％.本研究结果有望为进一步研究东北林蛙PI3K/Akt信号通路中PDK1基因的特性及功能奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	肖向红	东北林业大学野生动物资源学院	63	281	9.0	13.0
2	张晶钰	东北林业大学野生动物资源学院	25	62	5.0	7.0
3	柴龙会	东北林业大学野生动物资源学院	42	152	7.0	10.0
4	曲俐俐	东北林业大学野生动物资源学院	5	8	2.0	2.0
5	邵婕	东北林业大学野生动物资源学院	2	4	2.0	2.0
6	巩珊珊	东北林业大学野生动物资源学院	3	4	2.0	2.0